More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1719 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  90.33 
 
 		 539 aa  1010    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 539 aa  1105    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  65.56 
 
 		 545 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  69.72 
 
 		 542 aa  755    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  67.6 
 
 		 541 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  90.15 
 
 		 539 aa  1007    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  54.98 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  54.91 
 
 		 540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  54.92 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  55.1 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 		 556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  55.1 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  54.99 
 
 		 540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  53.28 
 
 		 546 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  54.63 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  52.96 
 
 		 547 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  53.99 
 
 		 556 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  54.07 
 
 		 615 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 547 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  53.95 
 
 		 540 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.8 
 
 		 531 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  54.72 
 
 		 540 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 		 548 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 548 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 567 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  52.43 
 
 		 560 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  52.31 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 		 552 aa  557  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  52.31 
 
 		 559 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 550 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  53.73 
 
 		 550 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  51.4 
 
 		 547 aa  552  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 552 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  54.21 
 
 		 649 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 562 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  51.19 
 
 		 550 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  52.58 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  50.83 
 
 		 549 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  51.3 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 		 549 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  51.87 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 541 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.28 
 
 		 551 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  52.35 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.64 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 548 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  50.28 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  53.06 
 
 		 543 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 550 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  50.28 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  48.08 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 550 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 543 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  53.38 
 
 		 550 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  48.35 
 
 		 550 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 554 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 554 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 550 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 554 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  47.64 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  47.46 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 526 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 545 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  51.86 
 
 		 550 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>