More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3177 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  58.2 
 
 
549 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  60.59 
 
 
539 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  66.36 
 
 
546 aa  734    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  58.21 
 
 
553 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
548 aa  1129    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  57.25 
 
 
549 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  58.17 
 
 
549 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
548 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  69.76 
 
 
543 aa  772    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  69.96 
 
 
543 aa  770    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  61.43 
 
 
561 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  59.14 
 
 
549 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  67.41 
 
 
546 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  65.8 
 
 
550 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  61.75 
 
 
556 aa  654    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  58.2 
 
 
548 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 
569 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  62.48 
 
 
570 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
548 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  66.54 
 
 
546 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  66.3 
 
 
649 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  60.19 
 
 
554 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  60.56 
 
 
554 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
548 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  57.83 
 
 
549 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  58.58 
 
 
548 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  57.83 
 
 
549 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  64.22 
 
 
543 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  61.47 
 
 
552 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  57.83 
 
 
549 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  63.03 
 
 
545 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  60.59 
 
 
539 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  58.01 
 
 
549 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  60.19 
 
 
554 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  59.52 
 
 
553 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  58.01 
 
 
549 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  57.83 
 
 
549 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  59.74 
 
 
565 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  57.72 
 
 
549 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  57.46 
 
 
550 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  56.91 
 
 
549 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  56.22 
 
 
567 aa  625  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  56.56 
 
 
552 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  57.33 
 
 
550 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  58.27 
 
 
547 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  56.83 
 
 
548 aa  621  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  58.36 
 
 
554 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  57.09 
 
 
550 aa  618  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  55.88 
 
 
549 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  56.54 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  55.33 
 
 
549 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  55.62 
 
 
554 aa  614  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 
550 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  55.22 
 
 
560 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  55.8 
 
 
550 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  55.47 
 
 
548 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  53.89 
 
 
546 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  56.59 
 
 
571 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  58.65 
 
 
560 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  53.64 
 
 
564 aa  601  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  53.85 
 
 
568 aa  600  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  55.66 
 
 
550 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  54.04 
 
 
549 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  57.95 
 
 
561 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
548 aa  593  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  53.27 
 
 
566 aa  592  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  58.67 
 
 
547 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  53.25 
 
 
553 aa  590  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  53.43 
 
 
547 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  54.53 
 
 
531 aa  586  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  52.01 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  53.7 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  53.18 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  55.75 
 
 
570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  52.61 
 
 
556 aa  569  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  54.49 
 
 
545 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 
539 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  52.32 
 
 
547 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 
545 aa  565  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  53.03 
 
 
541 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  54.24 
 
 
541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06037  phosphoglucose isomerase SwoM/PgiA (Eurofung)  56.51 
 
 
553 aa  559  1e-158  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0281434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  52.48 
 
 
545 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  51.56 
 
 
545 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  52.21 
 
 
545 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 
551 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  52.21 
 
 
545 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  52.21 
 
 
545 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  51.12 
 
 
548 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  54.84 
 
 
564 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  52.5 
 
 
545 aa  554  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>