More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1649 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  69.72 
 
 
539 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  63.38 
 
 
545 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
542 aa  1109    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  64.86 
 
 
541 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  68.04 
 
 
539 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1528  glucose-6-phosphate isomerase  67.29 
 
 
539 aa  731    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561375  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  56.98 
 
 
540 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  56.98 
 
 
556 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  57.73 
 
 
540 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  56.32 
 
 
556 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  57.25 
 
 
615 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  56.53 
 
 
540 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  56.72 
 
 
556 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  56.72 
 
 
556 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  56.31 
 
 
540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  54.32 
 
 
540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  54.89 
 
 
540 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  54.99 
 
 
540 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
531 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  54.34 
 
 
541 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  54.06 
 
 
548 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  47.89 
 
 
547 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  53.63 
 
 
548 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  52.43 
 
 
552 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 
547 aa  557  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  51.48 
 
 
559 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  51.01 
 
 
548 aa  553  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  52.68 
 
 
546 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  53.43 
 
 
548 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 
562 aa  548  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  52.35 
 
 
560 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 
551 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 
549 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  55.95 
 
 
547 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  53.21 
 
 
649 aa  538  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  47.87 
 
 
567 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 
549 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  51.19 
 
 
547 aa  537  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  50.94 
 
 
549 aa  538  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  55.18 
 
 
550 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 
545 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  52.53 
 
 
547 aa  529  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  54.17 
 
 
543 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 
545 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  52.24 
 
 
550 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 
545 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  54.05 
 
 
546 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 
539 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 
545 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  48.05 
 
 
548 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  48.34 
 
 
550 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  53.47 
 
 
543 aa  525  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  48.07 
 
 
545 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
550 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  53.86 
 
 
546 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 
545 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  49.26 
 
 
545 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  48.33 
 
 
548 aa  521  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  49.08 
 
 
545 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 
550 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 
545 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  50.39 
 
 
545 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  50.39 
 
 
545 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 
545 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  50.85 
 
 
539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  50.85 
 
 
539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 
552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  50.66 
 
 
548 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  47.87 
 
 
549 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  47.06 
 
 
556 aa  514  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  52.75 
 
 
526 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  48.32 
 
 
549 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 
549 aa  514  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.35 
 
 
549 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 
550 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  48.98 
 
 
548 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  47.05 
 
 
547 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  52.06 
 
 
543 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  52.8 
 
 
569 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  48.34 
 
 
545 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  47.5 
 
 
549 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  47.68 
 
 
549 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 
554 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  47.68 
 
 
549 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>