More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2458 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  67.11 
 
 		 530 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  74.86 
 
 		 529 aa  781    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  68.08 
 
 		 505 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  64.45 
 
 		 525 aa  675    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 529 aa  1076    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  70.94 
 
 		 530 aa  759    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  65.85 
 
 		 530 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  66.22 
 
 		 529 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  58.24 
 
 		 533 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  60.75 
 
 		 528 aa  631  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  60.75 
 
 		 526 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  61.54 
 
 		 528 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  62.92 
 
 		 528 aa  615  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  58.65 
 
 		 533 aa  615  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  61.34 
 
 		 529 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  59.76 
 
 		 526 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  59.76 
 
 		 526 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  58.58 
 
 		 528 aa  591  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  58 
 
 		 515 aa  559  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.94 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  52.77 
 
 		 532 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  50.39 
 
 		 532 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  52.17 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 532 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  48.63 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  45.63 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  45.44 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 527 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  30.87 
 
 		 539 aa  193  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  36.66 
 
 		 479 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.25 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  28.99 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  28.38 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 550 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 548 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.21 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  31.89 
 
 		 615 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 		 540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  34.89 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  31.99 
 
 		 450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  28.06 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  29.7 
 
 		 550 aa  163  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  31.48 
 
 		 540 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  32.24 
 
 		 545 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  32.1 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  29.58 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.78 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.72 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  31.82 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 		 549 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  32.03 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2177  glucose-6-phosphate isomerase  32.21 
 
 		 538 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  31.24 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  30.5 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 		 540 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  29 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  27.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 		 649 aa  160  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  31.48 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  30.33 
 
 		 540 aa  160  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 545 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  27.84 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  30.58 
 
 		 545 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  27.62 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 		 545 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  31.68 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>