More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3417 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  63.96 
 
 		 529 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  67.05 
 
 		 530 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  93.19 
 
 		 530 aa  1010    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  65.85 
 
 		 529 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  62.07 
 
 		 525 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  63.57 
 
 		 528 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  64.8 
 
 		 505 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  62.17 
 
 		 529 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 530 aa  1086    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  60.89 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  60.89 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  59.88 
 
 		 533 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  59.45 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  59.25 
 
 		 528 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  58.53 
 
 		 528 aa  608  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  58.46 
 
 		 528 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  55.38 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  59.61 
 
 		 529 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  53.47 
 
 		 536 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.98 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 532 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  54.65 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 532 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 527 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.79 
 
 		 527 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 527 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  32.58 
 
 		 539 aa  200  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  32.27 
 
 		 547 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.61 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  32.5 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 545 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  36.15 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  34.32 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  34.59 
 
 		 453 aa  172  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  28.81 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.89 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  34.68 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0657  glucose-6-phosphate isomerase  31.44 
 
 		 524 aa  169  9e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.63 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  31.26 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  29.89 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  31.87 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  30.89 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  31.04 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  30.26 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 		 549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  30.44 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0782  Glucose-6-phosphate isomerase  31.46 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  32.59 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  31.8 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  35.62 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  31.72 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  31.88 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  30.84 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  31.8 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  29.28 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  31.72 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  29.82 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  29.82 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  32.39 
 
 		 545 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  29.82 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 		 448 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 		 448 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  31.21 
 
 		 545 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  31.5 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  29.92 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 549 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  31.5 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 		 560 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  31.64 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  33.55 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  31.79 
 
 		 540 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  31.84 
 
 		 541 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  34.47 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>