More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4024 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  67.62 
 
 
529 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  73 
 
 
528 aa  812    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  71.16 
 
 
526 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  66.29 
 
 
528 aa  725    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  71.48 
 
 
528 aa  790    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  69.39 
 
 
526 aa  760    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  69.39 
 
 
526 aa  760    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
528 aa  1078    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
530 aa  623  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  59.25 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  58.66 
 
 
530 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  56.92 
 
 
529 aa  608  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  58.54 
 
 
533 aa  609  1e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  61.58 
 
 
525 aa  605  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  58.07 
 
 
529 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  58.58 
 
 
529 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  58.03 
 
 
505 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  52.41 
 
 
532 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  53.27 
 
 
552 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  52.2 
 
 
536 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  51 
 
 
533 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 
515 aa  522  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 
532 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  50.7 
 
 
532 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  47.59 
 
 
527 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  47.13 
 
 
527 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 
527 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  47.59 
 
 
527 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  30.37 
 
 
539 aa  188  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  36.9 
 
 
479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0782  Glucose-6-phosphate isomerase  33.62 
 
 
496 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.79 
 
 
545 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 
545 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  31.59 
 
 
547 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  32.03 
 
 
545 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 
548 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 
545 aa  177  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  32.51 
 
 
545 aa  177  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 
545 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  36.31 
 
 
477 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  31.9 
 
 
541 aa  176  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  32.06 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  33.04 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  31.55 
 
 
545 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  33.04 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  37 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  33.04 
 
 
545 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 
545 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  29.63 
 
 
549 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 
545 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  31.76 
 
 
545 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  31.42 
 
 
545 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 
540 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 
556 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 
549 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 
540 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0913  glucose-6 phosphate 1-epimerase  31.34 
 
 
547 aa  170  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 
562 aa  169  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  29.72 
 
 
556 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  29.72 
 
 
556 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  29.46 
 
 
540 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 
548 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  31.42 
 
 
545 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  31.62 
 
 
545 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1102  glucose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 
547 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.400634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  30.63 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 
453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 
549 aa  167  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  29.9 
 
 
556 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.43 
 
 
434 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  29.52 
 
 
567 aa  167  5e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  27.99 
 
 
549 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  30.18 
 
 
560 aa  166  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  30.58 
 
 
548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  30.8 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  29.64 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35 
 
 
445 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  29.9 
 
 
547 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  30.27 
 
 
542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  30.64 
 
 
547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  30.6 
 
 
552 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 
540 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  30.26 
 
 
533 aa  163  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 
540 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 
540 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 
540 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  29.14 
 
 
540 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
531 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>