More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1849 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 546 aa  1134    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17428  predicted protein  44.27 
 
 		 590 aa  422  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.006002  normal  0.594613 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_56512  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  42.27 
 
 		 786 aa  379  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  40.53 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  38.33 
 
 		 546 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  37.99 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  37.7 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  38.8 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 548 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  37.87 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  38.62 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  38.62 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  37.87 
 
 		 547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  38.66 
 
 		 531 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  38.29 
 
 		 549 aa  360  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 		 545 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  39.18 
 
 		 552 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  37.97 
 
 		 549 aa  359  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  40.08 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  38.26 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  39.89 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  38.06 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  37.17 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  36.94 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  38.11 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  39.56 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  40.72 
 
 		 547 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  37.45 
 
 		 562 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  37.01 
 
 		 548 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 545 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  39.32 
 
 		 539 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  39.32 
 
 		 539 aa  356  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  38.18 
 
 		 548 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  39.52 
 
 		 649 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  38.84 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  37.95 
 
 		 549 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  39.58 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  38.4 
 
 		 553 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  38.38 
 
 		 554 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 543 aa  352  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1719  glucose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  39.26 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  37.48 
 
 		 545 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0657  glucose-6-phosphate isomerase  39.68 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  37.29 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  36.97 
 
 		 545 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  37.01 
 
 		 545 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  38.25 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 		 554 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  38.53 
 
 		 541 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  37.2 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 545 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  37.61 
 
 		 554 aa  349  9e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  37.55 
 
 		 554 aa  349  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 		 545 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 		 551 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  37.15 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  37.15 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  37.62 
 
 		 554 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  36.69 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1861  glucose-6-phosphate isomerase  37.73 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  37.08 
 
 		 554 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 		 541 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  36.5 
 
 		 545 aa  346  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  37.85 
 
 		 547 aa  346  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  40.73 
 
 		 547 aa  346  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  38.39 
 
 		 549 aa  346  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 		 554 aa  346  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  39.09 
 
 		 542 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  39.46 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  38.39 
 
 		 549 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  37.85 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  39.18 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  37.41 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  38.72 
 
 		 549 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  37.76 
 
 		 545 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  37.2 
 
 		 548 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  38.07 
 
 		 545 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  35.65 
 
 		 550 aa  343  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 554 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  37.95 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  37.11 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  39.49 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  38.62 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  38.59 
 
 		 615 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  37.11 
 
 		 548 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  38.73 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  38.33 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 		 549 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>