More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  61.21 
 
 
561 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  58.39 
 
 
554 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  70.62 
 
 
560 aa  769    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  60.75 
 
 
552 aa  664    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1463  glucose-6-phosphate isomerase  74.15 
 
 
561 aa  831    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0410491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  72.63 
 
 
570 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11040  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
564 aa  1149    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0493698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1318  glucose-6-phosphate isomerase  64.16 
 
 
568 aa  731    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.321309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1025  glucose-6-phosphate isomerase  64.3 
 
 
566 aa  730    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  57.86 
 
 
554 aa  636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  69.04 
 
 
571 aa  782    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  57.86 
 
 
554 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0343  glucose-6-phosphate isomerase  64.17 
 
 
564 aa  747    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  59.27 
 
 
543 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  59.82 
 
 
565 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  58.3 
 
 
553 aa  631  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  57.5 
 
 
553 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  56.86 
 
 
549 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  57.66 
 
 
554 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  55.99 
 
 
569 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  56.74 
 
 
556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  57.71 
 
 
546 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  56.06 
 
 
649 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  57.61 
 
 
543 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7561  glucose-6-phosphate isomerase  58.76 
 
 
545 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  57.35 
 
 
546 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  57.33 
 
 
570 aa  591  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  55.78 
 
 
543 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  55.17 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  54.48 
 
 
548 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  54.84 
 
 
548 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0469  glucose-6-phosphate isomerase  53.85 
 
 
546 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  50.98 
 
 
549 aa  551  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  52.49 
 
 
559 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
539 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
539 aa  548  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  52.97 
 
 
547 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  53.32 
 
 
548 aa  541  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  50.53 
 
 
549 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 
550 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  52.67 
 
 
549 aa  538  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
539 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  51.95 
 
 
531 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  52.07 
 
 
562 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  50.72 
 
 
567 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  51.16 
 
 
552 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  51.78 
 
 
550 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
546 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  50.71 
 
 
550 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
549 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  51.44 
 
 
548 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
549 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  50.71 
 
 
549 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  54.79 
 
 
547 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  51.07 
 
 
549 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  49.47 
 
 
550 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  51.07 
 
 
549 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  50.89 
 
 
550 aa  524  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 
550 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  50.53 
 
 
549 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
550 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  50.99 
 
 
547 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  51.07 
 
 
549 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  51.66 
 
 
560 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 
549 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
548 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
548 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  52.72 
 
 
547 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  518  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
548 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  49.73 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  50.89 
 
 
549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  47.96 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  50.9 
 
 
545 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84923  phosphoglucoisomerase  50.45 
 
 
553 aa  512  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.154814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 
549 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  52.18 
 
 
541 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
548 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  50.71 
 
 
550 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  48.55 
 
 
548 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  49.55 
 
 
548 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
540 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 
540 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  49.55 
 
 
541 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 
556 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  49.08 
 
 
540 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 
556 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  49.27 
 
 
556 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 
549 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
615 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  46.94 
 
 
548 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>