More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1859 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  67.34 
 
 		 547 aa  778    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 549 aa  1110    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  58.49 
 
 		 541 aa  628  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  58.51 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  56.88 
 
 		 545 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  55.76 
 
 		 549 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  55.76 
 
 		 549 aa  601  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  55.41 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  56.31 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  54.95 
 
 		 549 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  56.66 
 
 		 547 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  52.86 
 
 		 531 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  53.65 
 
 		 548 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 549 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 552 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  55.75 
 
 		 534 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.74 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 567 aa  558  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  53.44 
 
 		 550 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  51.4 
 
 		 547 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  51.47 
 
 		 548 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 549 aa  555  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 546 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  50.28 
 
 		 548 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  49.18 
 
 		 552 aa  551  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  51.85 
 
 		 548 aa  552  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 562 aa  549  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  54.05 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 550 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  52.99 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 		 548 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  52.9 
 
 		 533 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  53.07 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  49.63 
 
 		 548 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  51.32 
 
 		 560 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 559 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  48.17 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  47.87 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  50.1 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 549 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 549 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 548 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  47.61 
 
 		 549 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  53.15 
 
 		 533 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 549 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 		 541 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  46.8 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  48.43 
 
 		 549 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.64 
 
 		 551 aa  527  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  48.76 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  51.47 
 
 		 649 aa  524  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  47.78 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 540 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 536 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 556 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 548 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 540 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  49.82 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 545 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 545 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 547 aa  502  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 545 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  46.14 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  50.38 
 
 		 539 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 553 aa  502  1e-141  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  50.38 
 
 		 539 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  46.03 
 
 		 545 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  46.2 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  46.38 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  49.53 
 
 		 549 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>