More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0378 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  62.64 
 
 		 549 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 541 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  62.45 
 
 		 549 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  64.66 
 
 		 533 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  63.14 
 
 		 534 aa  665    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  63.93 
 
 		 533 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  62.64 
 
 		 549 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  61.47 
 
 		 537 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  62.76 
 
 		 541 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 536 aa  1099    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  63.02 
 
 		 545 aa  690    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  60.45 
 
 		 541 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  63.31 
 
 		 541 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  63.13 
 
 		 533 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  62.76 
 
 		 533 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  61.9 
 
 		 547 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  53.3 
 
 		 549 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  51.22 
 
 		 547 aa  547  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  50.85 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  50.66 
 
 		 547 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  53.11 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  51.04 
 
 		 549 aa  537  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 562 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 552 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  50.85 
 
 		 548 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  48.31 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  49.44 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  49.16 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  50.66 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  49.16 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  48.97 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  50.95 
 
 		 560 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 		 548 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 		 548 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  49.13 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.97 
 
 		 549 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 549 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  48.79 
 
 		 548 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 550 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 549 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 549 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.25 
 
 		 543 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 549 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 548 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  51.86 
 
 		 549 aa  515  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 548 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  49.72 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.58 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 548 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  48.4 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  46.82 
 
 		 547 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 550 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  46.94 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  48.78 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  48.19 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 554 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 550 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 550 aa  508  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  46.89 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  51.89 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  52.68 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 		 554 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  50.37 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 		 649 aa  502  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  47.37 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 539 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  51.61 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  50.55 
 
 		 569 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  53.11 
 
 		 545 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  49.25 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  46.15 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  51.59 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  45.97 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>