More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0143 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1776  glucose-6-phosphate isomerase  59.29 
 
 
533 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.243279  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  69.03 
 
 
549 aa  771    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  69.03 
 
 
549 aa  771    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  96.67 
 
 
541 aa  1074    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2736  glucose-6-phosphate isomerase  59.67 
 
 
533 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  79.48 
 
 
541 aa  885    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
541 aa  1103    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  56.52 
 
 
549 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  65.56 
 
 
547 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0378  glucose-6-phosphate isomerase  62.38 
 
 
536 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419467  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  70.65 
 
 
545 aa  800    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  80.22 
 
 
541 aa  895    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1394  glucose-6-phosphate isomerase  59.51 
 
 
533 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  67.72 
 
 
549 aa  760    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  58.95 
 
 
534 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  58.02 
 
 
537 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  55.02 
 
 
548 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1950  glucose-6-phosphate isomerase  57.81 
 
 
533 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.0244382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  56.07 
 
 
531 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  55.6 
 
 
552 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  55.6 
 
 
547 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  55.43 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  56.33 
 
 
549 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  54.55 
 
 
548 aa  595  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  54.41 
 
 
549 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  57.36 
 
 
547 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
549 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 
548 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
549 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 
548 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  52.65 
 
 
549 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  54.34 
 
 
549 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  54.22 
 
 
549 aa  591  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  591  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  591  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
549 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  591  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 
548 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  54.34 
 
 
549 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  53.83 
 
 
546 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  53.35 
 
 
550 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  54.15 
 
 
549 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  53.28 
 
 
549 aa  586  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  54.15 
 
 
549 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  54.15 
 
 
549 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  53.85 
 
 
549 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  54.06 
 
 
547 aa  585  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  53.1 
 
 
548 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  54.58 
 
 
560 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  54.46 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 
548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  54.22 
 
 
549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  55.13 
 
 
549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  53.8 
 
 
550 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  54.05 
 
 
550 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
559 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  53.58 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  53.61 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  52.94 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  52.61 
 
 
550 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  53.41 
 
 
549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  52.08 
 
 
552 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  53.79 
 
 
550 aa  567  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  53.66 
 
 
550 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  53.18 
 
 
548 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  54.74 
 
 
541 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  50.97 
 
 
562 aa  556  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  53.01 
 
 
550 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  50.65 
 
 
547 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  51.31 
 
 
551 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  52.92 
 
 
548 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  51.84 
 
 
649 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  50.57 
 
 
550 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  48.3 
 
 
553 aa  534  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  49.03 
 
 
545 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  53.3 
 
 
549 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  52.74 
 
 
543 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  48.65 
 
 
547 aa  528  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  49.71 
 
 
539 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 
553 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 
545 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  48.19 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  52.98 
 
 
554 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  48.19 
 
 
545 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  48.19 
 
 
545 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1311  Glucose-6-phosphate isomerase  52.5 
 
 
560 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15279  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  48.26 
 
 
545 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  52.08 
 
 
543 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  51.78 
 
 
553 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  48 
 
 
545 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 
554 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 
543 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  47.9 
 
 
545 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 
554 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  48.21 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  53.09 
 
 
546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>