More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2020 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  67.27 
 
 		 529 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  67.74 
 
 		 530 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  68.08 
 
 		 529 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  64.8 
 
 		 530 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  64.13 
 
 		 530 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 505 aa  1048    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  68.13 
 
 		 529 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  61.95 
 
 		 525 aa  628  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  60.64 
 
 		 528 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 528 aa  621  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  60.52 
 
 		 528 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  57.63 
 
 		 526 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  57.63 
 
 		 526 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  58.03 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  56.63 
 
 		 526 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  57.63 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  57.8 
 
 		 533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  57.09 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  57.89 
 
 		 515 aa  549  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  54.82 
 
 		 536 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  53.41 
 
 		 552 aa  501  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  51.81 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 532 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  47.71 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  48.91 
 
 		 532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  44 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  44.2 
 
 		 527 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  27.47 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  32.09 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  30.84 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  30.82 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  30.97 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  29.92 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  36.89 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  30.57 
 
 		 545 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  30.75 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.44 
 
 		 445 aa  171  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  31.31 
 
 		 545 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  34.44 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  30.67 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 		 545 aa  169  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 649 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  31.39 
 
 		 545 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  31.12 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  30.24 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.52 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  30.71 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  28.36 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 543 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  29.84 
 
 		 540 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 		 547 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  29.84 
 
 		 556 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  34.05 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  31.87 
 
 		 549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  33.06 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.23 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  31.81 
 
 		 549 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 		 540 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  31.81 
 
 		 549 aa  163  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  35.41 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0782  Glucose-6-phosphate isomerase  32.46 
 
 		 496 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 554 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  29.51 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  31.04 
 
 		 547 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.27 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 		 525 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 		 540 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  32.79 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.24 
 
 		 547 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  32.44 
 
 		 545 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  29.26 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  30.17 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  28.63 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  29.04 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  29.74 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  26.81 
 
 		 545 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  31.17 
 
 		 547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  33.79 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>