More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0874 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
453 aa  932    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  67.04 
 
 
450 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  60.91 
 
 
457 aa  565  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  60.71 
 
 
448 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  60.71 
 
 
448 aa  565  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  47.54 
 
 
479 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  47.89 
 
 
477 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  51.6 
 
 
468 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  51.21 
 
 
464 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  46.19 
 
 
449 aa  361  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  44.65 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 
432 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  45.83 
 
 
445 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  46.26 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  36.7 
 
 
437 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  40.26 
 
 
434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  36.01 
 
 
437 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 
438 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  44.44 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  36.96 
 
 
441 aa  270  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  35.58 
 
 
439 aa  266  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  35.06 
 
 
430 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  38.07 
 
 
448 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.96 
 
 
430 aa  252  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.67 
 
 
435 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  39.1 
 
 
450 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  37.82 
 
 
449 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
437 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  35.04 
 
 
433 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  38.93 
 
 
450 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  38.83 
 
 
450 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  37.97 
 
 
449 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  36.63 
 
 
448 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  34.13 
 
 
449 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  34.96 
 
 
450 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  36.9 
 
 
451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  32.73 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  34.08 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  36.27 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.02 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  38.08 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  35.25 
 
 
405 aa  210  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  35.28 
 
 
450 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 
443 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  38.63 
 
 
422 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  31.86 
 
 
448 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  34.55 
 
 
449 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  33.58 
 
 
447 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  35.9 
 
 
443 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  35.47 
 
 
443 aa  206  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  35.9 
 
 
443 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  35.2 
 
 
443 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  35.2 
 
 
443 aa  206  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  36 
 
 
450 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  36.14 
 
 
406 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  34.41 
 
 
450 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  34.66 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  34.62 
 
 
453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  34.47 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  36.04 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  35.45 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
407 aa  199  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  32.53 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  33.42 
 
 
446 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  34.78 
 
 
401 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  32.62 
 
 
438 aa  189  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  34.71 
 
 
406 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  34.71 
 
 
406 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  32.74 
 
 
452 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  34.71 
 
 
406 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 
530 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  35.71 
 
 
533 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  35.66 
 
 
529 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  34.59 
 
 
530 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  35.16 
 
 
530 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  29.76 
 
 
427 aa  169  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 
528 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
536 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  32.47 
 
 
532 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  34.04 
 
 
529 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  34.89 
 
 
529 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 
527 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  33.06 
 
 
533 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 
528 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  35.52 
 
 
525 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 
515 aa  162  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  30.27 
 
 
527 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  29.6 
 
 
426 aa  160  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  35.56 
 
 
529 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>