More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0550 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  68.01 
 
 
450 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
443 aa  910    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  68.23 
 
 
450 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  68.46 
 
 
450 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  68.23 
 
 
450 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  68.23 
 
 
450 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  68.23 
 
 
450 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  92.33 
 
 
443 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  68.46 
 
 
450 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  67.79 
 
 
450 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  71.11 
 
 
449 aa  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  68.46 
 
 
450 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  69.64 
 
 
449 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  90.74 
 
 
443 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  68.68 
 
 
450 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  68.01 
 
 
450 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  90.74 
 
 
443 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  92.33 
 
 
443 aa  852    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  63.39 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  63.88 
 
 
450 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  63.7 
 
 
449 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  62.81 
 
 
449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  62.47 
 
 
451 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  63.88 
 
 
450 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  61.61 
 
 
450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  61.61 
 
 
448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  60.49 
 
 
452 aa  561  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  61.78 
 
 
450 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  59.95 
 
 
447 aa  558  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  58.85 
 
 
450 aa  536  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  57.33 
 
 
450 aa  534  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  55.48 
 
 
443 aa  504  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  57.99 
 
 
426 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  54.27 
 
 
438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  54.28 
 
 
427 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  52.63 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  50.11 
 
 
445 aa  455  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  53.79 
 
 
426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  47 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  46.09 
 
 
424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  32.44 
 
 
477 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
432 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  34.54 
 
 
464 aa  219  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.41 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.07 
 
 
445 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  35.47 
 
 
453 aa  206  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  35.29 
 
 
450 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  33.91 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  32.21 
 
 
449 aa  195  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.82 
 
 
445 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 
437 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 
437 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  30.69 
 
 
441 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  32.63 
 
 
437 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  32.37 
 
 
438 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf108  glucose-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
440 aa  182  2e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.621836  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.98 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
448 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
448 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  31.18 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 
430 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 
473 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  30.93 
 
 
450 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  34.81 
 
 
460 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  32.55 
 
 
433 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
453 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  29.59 
 
 
439 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.96 
 
 
435 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  28.71 
 
 
448 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  29.01 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  30.4 
 
 
401 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  30.59 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 
406 aa  140  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  30.59 
 
 
406 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 
405 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  30.19 
 
 
406 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  30.25 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  29.37 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  26.98 
 
 
407 aa  130  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  26.88 
 
 
444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.09 
 
 
948 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.13 
 
 
950 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  29.05 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  28.77 
 
 
532 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  31.71 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.47 
 
 
950 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  31.71 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 
536 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.9 
 
 
950 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  27.69 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 
526 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 
533 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  29.57 
 
 
528 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.94 
 
 
950 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>