More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1368 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
445 aa  913    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  54.12 
 
 
448 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  54.8 
 
 
448 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  53.9 
 
 
450 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
450 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  55.19 
 
 
449 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 
449 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  55.83 
 
 
451 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  56.04 
 
 
450 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  53.33 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  53.7 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  55.31 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  51.9 
 
 
443 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  51.9 
 
 
443 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.46 
 
 
450 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  50.11 
 
 
443 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  51.01 
 
 
443 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  51.01 
 
 
443 aa  458  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  53.7 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  53.11 
 
 
450 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  52.78 
 
 
426 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  52.15 
 
 
448 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
449 aa  435  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  51.81 
 
 
447 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  48.06 
 
 
452 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  48.08 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  48.03 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  42.36 
 
 
427 aa  374  1e-102  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  45.2 
 
 
446 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 
431 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  45 
 
 
438 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  40.56 
 
 
424 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  32.73 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  33.57 
 
 
477 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
479 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  36.44 
 
 
448 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  36.44 
 
 
448 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  35.24 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  32.28 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  33.5 
 
 
464 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.63 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  34.75 
 
 
450 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  33.26 
 
 
447 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  31.95 
 
 
449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 
441 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.29 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 
446 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.05 
 
 
445 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  32.63 
 
 
453 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  29.89 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  32.13 
 
 
473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  30.9 
 
 
437 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  30.92 
 
 
437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 
460 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  33.08 
 
 
430 aa  163  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  30.4 
 
 
448 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  32.07 
 
 
439 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  33.15 
 
 
437 aa  153  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  30.55 
 
 
405 aa  147  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.25 
 
 
435 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  32.58 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.08 
 
 
430 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  30.29 
 
 
406 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  27.72 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  27.74 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf108  glucose-6-phosphate isomerase  25.48 
 
 
440 aa  134  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.621836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  31.16 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  29.74 
 
 
950 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  31.9 
 
 
552 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.91 
 
 
948 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  26.8 
 
 
406 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.98 
 
 
950 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  30.16 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  28.42 
 
 
402 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.24 
 
 
950 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.4 
 
 
940 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  29.7 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.98 
 
 
965 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  28.91 
 
 
528 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  30.16 
 
 
527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  29.65 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.05 
 
 
941 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  29.54 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  30.56 
 
 
941 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  29.95 
 
 
533 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>