More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5018 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  59.27 
 
 
948 aa  1102    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  44.18 
 
 
920 aa  716    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  61.28 
 
 
950 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  69.98 
 
 
940 aa  1244    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  59.92 
 
 
965 aa  1107    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  70.86 
 
 
942 aa  1267    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  95.59 
 
 
941 aa  1773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  54.97 
 
 
943 aa  971    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  95.59 
 
 
941 aa  1769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  73.65 
 
 
948 aa  1365    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  59.77 
 
 
950 aa  1121    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  60.29 
 
 
950 aa  1128    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  60.08 
 
 
950 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  59.45 
 
 
950 aa  1117    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.28 
 
 
958 aa  767    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  56.9 
 
 
955 aa  1048    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  100 
 
 
940 aa  1883    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  41.59 
 
 
632 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  53.91 
 
 
377 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.59 
 
 
552 aa  364  4e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  49.59 
 
 
380 aa  353  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  51.1 
 
 
376 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  51.25 
 
 
365 aa  343  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  49.72 
 
 
381 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  48.49 
 
 
381 aa  334  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  44.77 
 
 
383 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  47.61 
 
 
383 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  47.14 
 
 
388 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  51.27 
 
 
371 aa  322  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  50.84 
 
 
648 aa  317  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  52.03 
 
 
381 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  46.26 
 
 
365 aa  303  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  44.63 
 
 
446 aa  301  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  48.56 
 
 
392 aa  299  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  47.9 
 
 
366 aa  298  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  47.75 
 
 
373 aa  297  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  46.39 
 
 
368 aa  296  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  48.28 
 
 
392 aa  296  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  46.84 
 
 
359 aa  295  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  45.81 
 
 
363 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  45.81 
 
 
363 aa  293  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  48.22 
 
 
371 aa  292  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.78 
 
 
543 aa  292  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  49.15 
 
 
369 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  45.4 
 
 
367 aa  291  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  47.32 
 
 
372 aa  290  8e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  46.53 
 
 
366 aa  290  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  45.38 
 
 
367 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  47.62 
 
 
372 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  47.25 
 
 
368 aa  289  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  39.07 
 
 
542 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.29 
 
 
534 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  47.65 
 
 
367 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  43.97 
 
 
367 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  40.7 
 
 
545 aa  285  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  45.82 
 
 
368 aa  284  6.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  43.96 
 
 
371 aa  283  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  41.69 
 
 
376 aa  283  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.41 
 
 
548 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  45.87 
 
 
373 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  38.96 
 
 
555 aa  281  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  45.6 
 
 
373 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  37.86 
 
 
533 aa  280  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  44.94 
 
 
373 aa  278  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 
544 aa  278  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.1 
 
 
539 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  41.11 
 
 
559 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  43.3 
 
 
373 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  43.28 
 
 
384 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  46.07 
 
 
1053 aa  273  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  44.03 
 
 
372 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  37.65 
 
 
547 aa  273  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  45.87 
 
 
368 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  44.03 
 
 
372 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  43.34 
 
 
369 aa  273  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  44.03 
 
 
372 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  43.47 
 
 
372 aa  273  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  44.19 
 
 
368 aa  273  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  45.11 
 
 
378 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  44 
 
 
371 aa  272  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.01 
 
 
572 aa  270  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  43.5 
 
 
371 aa  270  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  46.06 
 
 
377 aa  270  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  43.5 
 
 
371 aa  267  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  44.16 
 
 
370 aa  267  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  41.64 
 
 
368 aa  266  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  42.86 
 
 
372 aa  266  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  44.44 
 
 
387 aa  266  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  40.47 
 
 
555 aa  266  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.19 
 
 
542 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  44.51 
 
 
370 aa  264  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  45.28 
 
 
376 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  33.58 
 
 
568 aa  261  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  41.69 
 
 
374 aa  258  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.46 
 
 
532 aa  258  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  38.46 
 
 
580 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  35.79 
 
 
538 aa  254  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  41.48 
 
 
361 aa  254  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2162  transaldolase  45.32 
 
 
383 aa  248  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 
577 aa  247  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>