More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3670 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  60.51 
 
 		 941 aa  1103    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  60.4 
 
 		 941 aa  1100    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  78.32 
 
 		 950 aa  1504    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  65.08 
 
 		 940 aa  1167    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  73.34 
 
 		 965 aa  1417    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  73.05 
 
 		 948 aa  1411    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  60.29 
 
 		 940 aa  1113    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  63.62 
 
 		 948 aa  1162    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  79.26 
 
 		 950 aa  1527    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  100 
 
 		 950 aa  1911    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  78.63 
 
 		 950 aa  1524    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  73.89 
 
 		 950 aa  1438    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  47.38 
 
 		 958 aa  823    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  67.09 
 
 		 942 aa  1183    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  57.16 
 
 		 955 aa  1035    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  45.45 
 
 		 920 aa  741    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  56.5 
 
 		 943 aa  978    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  42.34 
 
 		 632 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0683  transaldolase  49.6 
 
 		 380 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0936811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3246  transaldolase  49.6 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0269  transaldolase  50.27 
 
 		 376 aa  366  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1622  transaldolase  51.98 
 
 		 377 aa  365  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.632626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.38 
 
 		 552 aa  361  3e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1497  transaldolase  46.92 
 
 		 383 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000044524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0048  transaldolase  49.2 
 
 		 365 aa  353  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1681  transaldolase  46.77 
 
 		 381 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3428  transaldolase  47.45 
 
 		 388 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1090  transaldolase  46.51 
 
 		 381 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2421  transaldolase  51.24 
 
 		 371 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2719  transaldolase  46.52 
 
 		 373 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0221  transaldolase  50.81 
 
 		 381 aa  317  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.108518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3090  transaldolase  49.16 
 
 		 392 aa  314  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1198  transaldolase  45.53 
 
 		 368 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.178231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1556  transaldolase  49.31 
 
 		 377 aa  310  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.538221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2003  transaldolase  48.25 
 
 		 368 aa  310  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2245  transaldolase  48.08 
 
 		 366 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2074  transaldolase  47.98 
 
 		 369 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.0887759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6014  Transaldolase  47.68 
 
 		 367 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.05295  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1648  transaldolase  47.97 
 
 		 371 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.178896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13200  transaldolase  45.84 
 
 		 387 aa  302  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2523  transaldolase  46.24 
 
 		 368 aa  302  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.634836  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4869  transaldolase  44.5 
 
 		 446 aa  302  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3317  transaldolase  47.11 
 
 		 392 aa  302  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.00145949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3220  transaldolase  46.7 
 
 		 648 aa  301  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0581  transaldolase  46.26 
 
 		 363 aa  300  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0419  transaldolase  46.26 
 
 		 363 aa  300  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.332774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0665  transaldolase  46.32 
 
 		 359 aa  300  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2923  transaldolase  45.79 
 
 		 373 aa  300  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0170  transaldolase  46.81 
 
 		 365 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2096  transaldolase  46.05 
 
 		 371 aa  297  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.968254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2373  transaldolase  46.32 
 
 		 372 aa  297  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3642  transaldolase  46.07 
 
 		 384 aa  294  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0794941  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1935  transaldolase  47.75 
 
 		 376 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2213  transaldolase  45.36 
 
 		 373 aa  293  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2062  transaldolase  44.63 
 
 		 366 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4495  transaldolase  45.41 
 
 		 368 aa  293  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.595041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.95 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1126  transaldolase  44.88 
 
 		 372 aa  291  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0230919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0441  transaldolase  45.13 
 
 		 367 aa  290  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15970  transaldolase  45.04 
 
 		 373 aa  289  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310395  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2057  transaldolase  47.38 
 
 		 367 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19950  transaldolase  45.18 
 
 		 378 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  45.21 
 
 		 1053 aa  288  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1837  transaldolase  44.95 
 
 		 371 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000480192 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3693  transaldolase  45.53 
 
 		 371 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.995782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11476  transaldolase  44.69 
 
 		 373 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00336068  normal  0.323964 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0903  transaldolase  44.69 
 
 		 367 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.8 
 
 		 539 aa  284  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2453  transaldolase  46.43 
 
 		 372 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2413  transaldolase  46.43 
 
 		 372 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2459  transaldolase  46.43 
 
 		 372 aa  283  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.815589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2057  transaldolase  41.4 
 
 		 376 aa  281  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000591024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  39.09 
 
 		 545 aa  280  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11420  transaldolase  45.38 
 
 		 372 aa  279  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.212185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2540  transaldolase  44.59 
 
 		 370 aa  279  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  39.78 
 
 		 542 aa  277  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2719  transaldolase  45.4 
 
 		 372 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2975  transaldolase  44.86 
 
 		 368 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1981  transaldolase  43.84 
 
 		 368 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.430126  normal  0.891493 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  33.76 
 
 		 568 aa  274  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.31 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5187  transaldolase  43.82 
 
 		 370 aa  271  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.84 
 
 		 543 aa  270  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15260  transaldolase  43.97 
 
 		 371 aa  269  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1509  transaldolase  42.01 
 
 		 374 aa  269  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0933746  normal  0.056885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  36.63 
 
 		 547 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  38.91 
 
 		 533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.4 
 
 		 559 aa  268  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  34.84 
 
 		 577 aa  268  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0088  transaldolase  40.8 
 
 		 361 aa  268  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.40765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.14 
 
 		 548 aa  267  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2261  transaldolase  43.56 
 
 		 369 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00484192  normal  0.0538935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1953  transaldolase  41.08 
 
 		 382 aa  265  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  37.52 
 
 		 544 aa  264  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 555 aa  263  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1009  transaldolase  42.86 
 
 		 357 aa  263  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.18 
 
 		 555 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  38.38 
 
 		 538 aa  260  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3708  transaldolase  40 
 
 		 360 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.93 
 
 		 532 aa  249  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>