More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2677 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
432 aa  867    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  43.57 
 
 
457 aa  353  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  47.41 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  43.21 
 
 
479 aa  339  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  50.13 
 
 
468 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  45.07 
 
 
464 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  39.05 
 
 
450 aa  323  3e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 
453 aa  319  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  40.18 
 
 
449 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  41.48 
 
 
448 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  41.48 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  51.87 
 
 
460 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  45.61 
 
 
445 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  46.4 
 
 
473 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  43.73 
 
 
441 aa  273  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  43.78 
 
 
445 aa  270  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  36.21 
 
 
438 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  36.21 
 
 
437 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  35.75 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  35.4 
 
 
439 aa  260  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  40.58 
 
 
430 aa  256  4e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  40.7 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  33.86 
 
 
451 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  43.83 
 
 
437 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  45.03 
 
 
435 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.96 
 
 
434 aa  247  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  36.12 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 
450 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  35.67 
 
 
450 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  35.44 
 
 
450 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  37.31 
 
 
450 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  40.21 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  45.63 
 
 
433 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  35.65 
 
 
449 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  34.98 
 
 
449 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  34.3 
 
 
448 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  38.55 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  35.67 
 
 
449 aa  229  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  33.25 
 
 
448 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.65 
 
 
450 aa  226  7e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  39.29 
 
 
447 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 
449 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  38.1 
 
 
406 aa  223  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  35.94 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
443 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
443 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 
450 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  33.94 
 
 
449 aa  219  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
443 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 
448 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  38.07 
 
 
446 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  32.72 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  32.72 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  34.01 
 
 
422 aa  212  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  37.33 
 
 
444 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 
450 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  32.76 
 
 
438 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  30.07 
 
 
443 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 
431 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  34.6 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
407 aa  199  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  33.02 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  31.78 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  31.74 
 
 
450 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  32.58 
 
 
452 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  32.86 
 
 
446 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  31.74 
 
 
450 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  32.3 
 
 
406 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  32.3 
 
 
406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  32.02 
 
 
406 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  29.75 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  28.22 
 
 
427 aa  170  4e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  35.2 
 
 
424 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  34.11 
 
 
529 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  31.46 
 
 
505 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  35.99 
 
 
530 aa  149  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  32.66 
 
 
528 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  35.97 
 
 
530 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 
532 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  34.82 
 
 
530 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 
526 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 
533 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  32.88 
 
 
536 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  34.33 
 
 
528 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 
526 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  33.88 
 
 
526 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 
525 aa  142  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>