More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1372 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  68.13 
 
 		 505 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  63.95 
 
 		 529 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  62.17 
 
 		 530 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  66.16 
 
 		 530 aa  706    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  66.22 
 
 		 529 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 529 aa  1083    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  62.74 
 
 		 530 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  61.49 
 
 		 525 aa  625  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  58.75 
 
 		 528 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  57.48 
 
 		 528 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  60.74 
 
 		 528 aa  618  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  56.65 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  57.48 
 
 		 526 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  56.92 
 
 		 528 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  57.48 
 
 		 526 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  55.92 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  57.67 
 
 		 529 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  54.75 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.73 
 
 		 552 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  53.73 
 
 		 536 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  54.74 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  53.29 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  51.37 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  51.58 
 
 		 532 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  51.7 
 
 		 532 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 527 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  45.8 
 
 		 527 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 527 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  35.06 
 
 		 479 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  30.77 
 
 		 546 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  29.8 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 552 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  28.92 
 
 		 547 aa  182  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  32.62 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0796  glucose-6-phosphate isomerase  32.7 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  30.75 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  32.5 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  30.2 
 
 		 549 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.69 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.93 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  35.66 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  28.44 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  30.04 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.49 
 
 		 437 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  30.71 
 
 		 545 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 		 545 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  32.72 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0825  glucose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 549 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.18 
 
 		 445 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  32.38 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 		 438 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  32.15 
 
 		 545 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  34.77 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  31.92 
 
 		 549 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0581  glucose-6-phosphate isomerase  33.68 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  31.93 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  31.29 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  29.04 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  31.93 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  32.33 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  31.29 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  31.93 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  30.83 
 
 		 545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0290  glucose-6-phosphate isomerase  32.16 
 
 		 553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1008  Glucose-6-phosphate isomerase  32.87 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.6147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  31.15 
 
 		 545 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 		 562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  28.79 
 
 		 550 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  31.49 
 
 		 545 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0782  Glucose-6-phosphate isomerase  30.93 
 
 		 496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  32.4 
 
 		 437 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  30.6 
 
 		 546 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  32.61 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  32.91 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  31.92 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  32.2 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  30.89 
 
 		 547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  30.13 
 
 		 547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 560 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  30.6 
 
 		 549 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  29.35 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  30.72 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>