More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3752 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  68.12 
 
 
529 aa  711    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  67.05 
 
 
530 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  62.4 
 
 
528 aa  642    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  61.02 
 
 
528 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  70.94 
 
 
529 aa  759    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  63.58 
 
 
528 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
530 aa  1084    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  67.74 
 
 
505 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  68.37 
 
 
530 aa  737    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  66.16 
 
 
529 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  65.5 
 
 
525 aa  660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 
526 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  59.31 
 
 
533 aa  625  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 
526 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  57.12 
 
 
533 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  60.24 
 
 
526 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  58.66 
 
 
528 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  58.56 
 
 
529 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  58.84 
 
 
515 aa  561  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  54.38 
 
 
552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  53.19 
 
 
536 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  51.59 
 
 
532 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 
532 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 
532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  47.98 
 
 
532 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  45.09 
 
 
527 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  44.22 
 
 
527 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  44.29 
 
 
527 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  45.47 
 
 
527 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  33.11 
 
 
539 aa  194  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.8 
 
 
434 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  38.2 
 
 
479 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 
547 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 
545 aa  173  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 
525 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 
545 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1849  glucose-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
546 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.49 
 
 
445 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  32.19 
 
 
540 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  171  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  35.08 
 
 
449 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  31.05 
 
 
562 aa  170  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  35.16 
 
 
453 aa  170  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 
457 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 
545 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  33.03 
 
 
556 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  31.19 
 
 
545 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  33.03 
 
 
556 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  31.7 
 
 
545 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 
540 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  33.11 
 
 
615 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 
473 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  167  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  31.74 
 
 
540 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  31.15 
 
 
545 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  32.07 
 
 
540 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  32.07 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  31.15 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  33.11 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.56 
 
 
445 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 
545 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  30.87 
 
 
547 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 
477 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  29.71 
 
 
548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  30.45 
 
 
530 aa  163  7e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  30.94 
 
 
545 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 
437 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  30.94 
 
 
545 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  33.82 
 
 
554 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  35.96 
 
 
464 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
554 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  31.96 
 
 
554 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 
448 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  32.06 
 
 
556 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  31.27 
 
 
554 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 
540 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 
448 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  31.16 
 
 
545 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  33.82 
 
 
554 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  30.61 
 
 
545 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 
438 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  30.64 
 
 
549 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  31.56 
 
 
547 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1008  Glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
553 aa  161  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.6147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  31.17 
 
 
554 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0307  glucose-6-phosphate isomerase  31.11 
 
 
549 aa  161  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  30.64 
 
 
549 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  31.08 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  31.16 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  32 
 
 
552 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  30.96 
 
 
545 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  31.69 
 
 
554 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
554 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  31.65 
 
 
439 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>