More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2119 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 552 aa  1108    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  50.93 
 
 		 548 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  50.83 
 
 		 548 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  51.98 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  52.29 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  51.65 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  48.07 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0370  Glucose-6-phosphate isomerase  51.04 
 
 		 561 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  48.51 
 
 		 549 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  48.16 
 
 		 550 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 548 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  50.47 
 
 		 649 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 552 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05060  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 560 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 562 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  48.13 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  45.92 
 
 		 547 aa  498  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  49.07 
 
 		 547 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 543 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  44.67 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 552 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3178  glucose-6-phosphate isomerase  53.1 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1857  glucose-6-phosphate isomerase  48.8 
 
 		 549 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145522  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  53.12 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  44.53 
 
 		 567 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  48.93 
 
 		 550 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2191  Glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 		 543 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  46.04 
 
 		 548 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3080  glucose-6-phosphate isomerase  53.1 
 
 		 550 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  47 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3272  glucose-6-phosphate isomerase  52.71 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.701393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.74 
 
 		 543 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  47.2 
 
 		 559 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  48.64 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  50.59 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 549 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0045  glucose-6-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  46.35 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  49.9 
 
 		 550 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  44.07 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10963  glucose-6-phosphate isomerase  48.69 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3338  Glucose-6-phosphate isomerase  50.38 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  46.93 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  47.78 
 
 		 547 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  46.93 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  47.31 
 
 		 549 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  46.93 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4877  glucose-6-phosphate isomerase  48.54 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4714  glucose-6-phosphate isomerase  49.43 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4334  glucose-6-phosphate isomerase  49.43 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  45.81 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 549 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4420  glucose-6-phosphate isomerase  49.43 
 
 		 554 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  47.54 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1334  Glucose-6-phosphate isomerase  49.04 
 
 		 565 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.994679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 549 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  48.41 
 
 		 541 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  46.24 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  49.15 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  47.59 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  0.00000207698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 549 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0183  Glucose-6-phosphate isomerase  48.81 
 
 		 571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  49.15 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  48.77 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  47.88 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 549 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  48.55 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  46.24 
 
 		 549 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 554 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  48.25 
 
 		 569 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  46.64 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  43.26 
 
 		 539 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.71 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 545 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7286  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 		 570 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.813116  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 541 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  46.26 
 
 		 541 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  45.12 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>