More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0320 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
532 aa  1080    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  59.13 
 
 
532 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  96.99 
 
 
532 aa  1049    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  57.44 
 
 
552 aa  628  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  56.69 
 
 
536 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  57.61 
 
 
527 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  57.42 
 
 
527 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  56.87 
 
 
527 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  57.42 
 
 
527 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  60.26 
 
 
532 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  53.2 
 
 
533 aa  527  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  50.76 
 
 
528 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 
530 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  51.76 
 
 
530 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  50.94 
 
 
528 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  50.76 
 
 
528 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  49.81 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  50.57 
 
 
526 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  50.57 
 
 
526 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  50.19 
 
 
529 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  49.62 
 
 
526 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  51.37 
 
 
529 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  50.39 
 
 
529 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  49.01 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  47.43 
 
 
505 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  48.53 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  48.47 
 
 
515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  45.15 
 
 
533 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2573  glucose-6-phosphate isomerase  31.96 
 
 
525 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00324462  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  30.51 
 
 
545 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  31.49 
 
 
547 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  29.28 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.77 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  33.97 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  35.07 
 
 
479 aa  173  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  29.12 
 
 
541 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  29.57 
 
 
545 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  30.72 
 
 
545 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  29.16 
 
 
549 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 
549 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  29.72 
 
 
545 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
549 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  29.02 
 
 
553 aa  168  2.9999999999999998e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  28.25 
 
 
547 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
549 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
549 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  30.57 
 
 
545 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  29.56 
 
 
549 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2119  Glucose-6-phosphate isomerase  30.68 
 
 
552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0430441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  30.44 
 
 
547 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  30.1 
 
 
545 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  32.37 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  29.75 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 
541 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 
549 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  29.39 
 
 
549 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  29.02 
 
 
549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 
550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 
545 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  27.81 
 
 
550 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  28.33 
 
 
548 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  28.33 
 
 
548 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 
548 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  28.33 
 
 
548 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  29.47 
 
 
545 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  29.69 
 
 
549 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  29.5 
 
 
547 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 
550 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  31.95 
 
 
549 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  31.95 
 
 
549 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  26.95 
 
 
549 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 
545 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  29.71 
 
 
545 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  29.87 
 
 
548 aa  160  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  28.35 
 
 
549 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.56 
 
 
445 aa  160  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  29.15 
 
 
531 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.6 
 
 
434 aa  159  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  29.78 
 
 
541 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  28.06 
 
 
552 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  31.71 
 
 
549 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  29.98 
 
 
453 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  27.7 
 
 
556 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  29.86 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  32.88 
 
 
464 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  29.37 
 
 
547 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  28.98 
 
 
547 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  29.87 
 
 
562 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0755  glucose-6-phosphate isomerase  29.27 
 
 
530 aa  157  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>