277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  56.99 
 
 		 572 aa  641    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 577 aa  1186    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  55.81 
 
 		 568 aa  622  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.48 
 
 		 950 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  34.91 
 
 		 950 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.71 
 
 		 948 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.42 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  34.84 
 
 		 950 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.78 
 
 		 950 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.33 
 
 		 632 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  35.63 
 
 		 920 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.91 
 
 		 958 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.27 
 
 		 943 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.99 
 
 		 941 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.52 
 
 		 948 aa  256  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.4 
 
 		 940 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.99 
 
 		 941 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  36.23 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  31.68 
 
 		 955 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  33.33 
 
 		 950 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  36.69 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.8 
 
 		 940 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.14 
 
 		 942 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.45 
 
 		 965 aa  237  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  36.11 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.68 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.64 
 
 		 534 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  33.39 
 
 		 545 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.39 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.38 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.8 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  32.05 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.73 
 
 		 555 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.96 
 
 		 559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  34 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  32.28 
 
 		 580 aa  203  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  34.54 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.69 
 
 		 532 aa  198  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  29.36 
 
 		 541 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  29.38 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  28.81 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  25.65 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  28.49 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  29.1 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  34.91 
 
 		 515 aa  110  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 528 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  27.84 
 
 		 448 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  27.84 
 
 		 448 aa  106  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  34.45 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 525 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  33.08 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  32.92 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  35.94 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  35.94 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 		 533 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  32.5 
 
 		 529 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  27.34 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  37.21 
 
 		 532 aa  99.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  32.46 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  28.07 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  27.91 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  33.19 
 
 		 533 aa  97.8  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 		 432 aa  97.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  26.32 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  28.78 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  27.2 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  29.96 
 
 		 405 aa  95.1  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 529 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  32.11 
 
 		 528 aa  94.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  33.18 
 
 		 532 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  28.23 
 
 		 552 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 		 527 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  29.7 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  27.24 
 
 		 450 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  30.83 
 
 		 529 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  30.52 
 
 		 529 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 424 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  32.74 
 
 		 536 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  26.03 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  31.6 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  25.75 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  34.21 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  26.87 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  35.91 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  27.03 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  27.03 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  26.85 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.59 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2020  glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  26.78 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  26.78 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>