226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2539 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 555 aa  1092    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  58.32 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  56.34 
 
 		 543 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  55.21 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  57.14 
 
 		 533 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  55.27 
 
 		 542 aa  485  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  57.39 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 		 544 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  52.62 
 
 		 542 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  51.86 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  54.17 
 
 		 580 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.76 
 
 		 548 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  52.44 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.29 
 
 		 532 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  48.82 
 
 		 547 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  52.75 
 
 		 555 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  40.26 
 
 		 941 aa  290  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.89 
 
 		 941 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  41.05 
 
 		 541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  40.68 
 
 		 920 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.96 
 
 		 940 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.67 
 
 		 950 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.72 
 
 		 552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.19 
 
 		 950 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.74 
 
 		 950 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.07 
 
 		 950 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.09 
 
 		 948 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.21 
 
 		 958 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.43 
 
 		 948 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37 
 
 		 955 aa  263  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.96 
 
 		 950 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.63 
 
 		 942 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.98 
 
 		 632 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.5 
 
 		 965 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  35.59 
 
 		 568 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.43 
 
 		 943 aa  249  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.52 
 
 		 940 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.15 
 
 		 572 aa  246  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  36.23 
 
 		 577 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  27.59 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  25.81 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  23.87 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  23.81 
 
 		 406 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  26.18 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 434 aa  107  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  23.68 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  28.16 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  29.02 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  38.14 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  25.69 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  29.77 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  27.2 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  29.31 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  30.5 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  28.7 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.47 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  28.72 
 
 		 449 aa  100  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  29.28 
 
 		 525 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  31.28 
 
 		 453 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  27.64 
 
 		 405 aa  97.8  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  27.08 
 
 		 449 aa  97.4  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.21 
 
 		 430 aa  97.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 		 526 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  28.53 
 
 		 526 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 		 526 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  34.42 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  30.12 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  29.2 
 
 		 528 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.21 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  28.49 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  30.17 
 
 		 447 aa  94  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  25.88 
 
 		 445 aa  94  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  27.72 
 
 		 533 aa  93.6  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  29.94 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  26 
 
 		 426 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  29.33 
 
 		 449 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 		 530 aa  92.8  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  26.05 
 
 		 453 aa  92  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  25.9 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  26.34 
 
 		 443 aa  90.9  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  29.43 
 
 		 422 aa  90.5  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  28.13 
 
 		 528 aa  90.5  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  29.94 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  25.57 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  27.25 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  31.01 
 
 		 444 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  26.26 
 
 		 449 aa  88.2  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  26.5 
 
 		 527 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  31.32 
 
 		 443 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  31.32 
 
 		 443 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  25.9 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  28.69 
 
 		 528 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  24.52 
 
 		 457 aa  87.4  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  25.9 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  28 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 438 aa  87.4  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  29.39 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>