More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1952 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  100 
 
 		 632 aa  1278    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.42 
 
 		 958 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.25 
 
 		 950 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.38 
 
 		 950 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.7 
 
 		 948 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.31 
 
 		 950 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  42.03 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.77 
 
 		 943 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.5 
 
 		 955 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.4 
 
 		 948 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.96 
 
 		 965 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  43.41 
 
 		 920 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  43.22 
 
 		 950 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.34 
 
 		 950 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.15 
 
 		 942 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  44.94 
 
 		 940 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.38 
 
 		 941 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  42.48 
 
 		 941 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  41.59 
 
 		 940 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  38.34 
 
 		 547 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  40.22 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.09 
 
 		 543 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.45 
 
 		 572 aa  283  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.96 
 
 		 542 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.41 
 
 		 539 aa  276  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  37.7 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  40.29 
 
 		 542 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.74 
 
 		 534 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.73 
 
 		 559 aa  265  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  33.21 
 
 		 577 aa  265  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  38.67 
 
 		 555 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  37.22 
 
 		 545 aa  261  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  37.75 
 
 		 548 aa  259  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  37.98 
 
 		 555 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  37.18 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  32.6 
 
 		 568 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.33 
 
 		 532 aa  243  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  36.12 
 
 		 580 aa  230  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.78 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  27.23 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  26.15 
 
 		 437 aa  111  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  29.12 
 
 		 450 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  27.44 
 
 		 439 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  25.38 
 
 		 437 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  29.44 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  28.41 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  29.43 
 
 		 406 aa  107  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 		 441 aa  107  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  25.33 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  27.02 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 422 aa  106  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  27.9 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  27.86 
 
 		 528 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  26.68 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  28.88 
 
 		 528 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  28.85 
 
 		 444 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  26.84 
 
 		 449 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 		 446 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  28.68 
 
 		 405 aa  98.6  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  26.36 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 		 528 aa  97.4  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  29.48 
 
 		 401 aa  97.1  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  28.09 
 
 		 424 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  25.77 
 
 		 406 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 536 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  28.36 
 
 		 468 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  25.7 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  27.01 
 
 		 552 aa  95.1  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  27.3 
 
 		 464 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  27.09 
 
 		 438 aa  94.7  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.05 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  25.42 
 
 		 406 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  31.41 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  31.41 
 
 		 526 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  26.86 
 
 		 525 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  26.42 
 
 		 532 aa  91.3  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  26.47 
 
 		 526 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  26.6 
 
 		 453 aa  90.9  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  27.51 
 
 		 448 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  30.86 
 
 		 405 aa  89.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  26.18 
 
 		 446 aa  90.1  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  27.69 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  25.64 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.97 
 
 		 449 aa  88.2  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  28.39 
 
 		 473 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 		 533 aa  87.4  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  28.07 
 
 		 437 aa  87.4  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  32.43 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 		 443 aa  87  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  27.01 
 
 		 448 aa  86.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  24.94 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  23.35 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  24.94 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  24.94 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  24.69 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>