193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
580 aa  1136    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  52.43 
 
 
543 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  51.92 
 
 
545 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  54.17 
 
 
555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  52.17 
 
 
533 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  50.34 
 
 
539 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  49.14 
 
 
538 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  50.26 
 
 
544 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  46.35 
 
 
547 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  49.64 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  47.64 
 
 
534 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  48.04 
 
 
542 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  46.38 
 
 
542 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  47.71 
 
 
548 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  50.18 
 
 
555 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  48.75 
 
 
532 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.89 
 
 
950 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.46 
 
 
940 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.37 
 
 
941 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.19 
 
 
941 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.81 
 
 
948 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.97 
 
 
943 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.3 
 
 
950 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.64 
 
 
955 aa  253  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.11 
 
 
950 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.29 
 
 
950 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.52 
 
 
940 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.79 
 
 
942 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.45 
 
 
552 aa  243  7e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.12 
 
 
632 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  34.16 
 
 
568 aa  242  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.64 
 
 
950 aa  241  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.25 
 
 
948 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.61 
 
 
965 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  36.4 
 
 
541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.16 
 
 
572 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  35.84 
 
 
920 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  32.33 
 
 
958 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  32.28 
 
 
577 aa  217  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  28.95 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  29.09 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  26.52 
 
 
449 aa  124  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  28.03 
 
 
439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  26.77 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.8 
 
 
450 aa  114  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  31.07 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 
441 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  27.49 
 
 
448 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  25.43 
 
 
434 aa  107  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  27.41 
 
 
405 aa  107  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  28.47 
 
 
448 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  28.47 
 
 
448 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  26.86 
 
 
401 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  27.44 
 
 
405 aa  104  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  25.86 
 
 
406 aa  103  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
424 aa  103  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  30.52 
 
 
432 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  29.53 
 
 
525 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  28.42 
 
 
464 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  29.69 
 
 
529 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  32.63 
 
 
437 aa  100  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  29.26 
 
 
431 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  25 
 
 
407 aa  100  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  25.06 
 
 
443 aa  100  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 
479 aa  97.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  28.74 
 
 
515 aa  97.4  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.15 
 
 
449 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  28.32 
 
 
445 aa  97.1  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 
533 aa  97.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  26.3 
 
 
453 aa  97.1  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  23.65 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
528 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  26.65 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  26.65 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  27.3 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  26.1 
 
 
426 aa  95.9  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  26.88 
 
 
446 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  26.01 
 
 
448 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  29.79 
 
 
450 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 
528 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  24 
 
 
406 aa  94.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  24.36 
 
 
406 aa  94  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  28.09 
 
 
430 aa  94  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  28.88 
 
 
453 aa  93.6  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  25.12 
 
 
427 aa  93.6  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  27.23 
 
 
533 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  28.75 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  27.96 
 
 
450 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  28.35 
 
 
450 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 
530 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  26.6 
 
 
443 aa  92  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
450 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
450 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  26.53 
 
 
443 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  26.53 
 
 
443 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  27.07 
 
 
450 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>