More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2420 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2420  phosphoglucose isomerase (PGI)  100 
 
 
534 aa  1054    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3318  phosphoglucose isomerase (PGI)  61.64 
 
 
559 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3091  phosphoglucose isomerase (PGI)  62.4 
 
 
555 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2212  phosphoglucose isomerase (PGI)  55 
 
 
548 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00695787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2056  phosphoglucose isomerase (PGI)  55.81 
 
 
532 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.477851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1982  phosphoglucose isomerase  52.91 
 
 
547 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.686812  normal  0.830711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1125  glucose-6-phosphate isomerase  56.36 
 
 
542 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2004  glucose-6-phosphate isomerase  53.47 
 
 
544 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6015  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.21 
 
 
542 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0253937  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5188  phosphoglucose isomerase (PGI)  53.88 
 
 
539 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15960  glucose-6-phosphate isomerase  52.59 
 
 
538 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0967147  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2095  glucose-6-phosphate isomerase  51.68 
 
 
545 aa  465  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.218405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  51.86 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11410  glucose-6-phosphate isomerase  53.54 
 
 
533 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1836  phosphoglucose isomerase (PGI)  50.77 
 
 
543 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13190  glucose-6-phosphate isomerase  47.83 
 
 
580 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.248571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1277  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.44 
 
 
943 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2349  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.54 
 
 
955 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.36478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5018  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.04 
 
 
940 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.391428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.56 
 
 
958 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4965  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.2 
 
 
941 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.205823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.7 
 
 
950 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4502  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.02 
 
 
941 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270677  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.31 
 
 
950 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  39.24 
 
 
950 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3474  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  38.17 
 
 
950 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2211  phosphoglucose isomerase (PGI)  39.11 
 
 
541 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00026679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1952  phosphoglucose isomerase (PGI)  35.92 
 
 
632 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569883  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.53 
 
 
948 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0592269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6315  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.33 
 
 
948 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4691  transaldolase  38.75 
 
 
920 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.671284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.85 
 
 
950 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7445  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  36.1 
 
 
942 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1116  phosphoglucose isomerase (PGI)  34.59 
 
 
552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6706  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  37.12 
 
 
940 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2641  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  35.48 
 
 
965 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00480  glucose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
577 aa  230  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01170  glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 
568 aa  225  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0139  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.73 
 
 
572 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149343  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  27.01 
 
 
422 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  33.03 
 
 
401 aa  107  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  29.92 
 
 
432 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  30.15 
 
 
444 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  26.46 
 
 
438 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.13 
 
 
450 aa  100  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  31.52 
 
 
468 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  34.13 
 
 
406 aa  99  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  27.08 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  29.66 
 
 
525 aa  97.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  25.69 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  25.78 
 
 
406 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3777  glucose-6-phosphate isomerase  27.07 
 
 
526 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.648123 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  26.33 
 
 
405 aa  93.6  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  25.41 
 
 
405 aa  92  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  24.54 
 
 
406 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  25.5 
 
 
406 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 
407 aa  92.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 
479 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  27.35 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  25.77 
 
 
450 aa  90.1  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  30.84 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  26.7 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  25.31 
 
 
453 aa  90.1  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  27.35 
 
 
526 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  33.48 
 
 
529 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 
528 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  27.32 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  29.65 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  24.16 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  25.06 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  25.51 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  33.6 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  26.87 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  26.87 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  32.96 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  34.55 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  25.13 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  32.05 
 
 
528 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  26.07 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  26.61 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.34 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.7 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  26.61 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  26.29 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  27.81 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  28.49 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2458  glucose-6-phosphate isomerase  34.53 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520151  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  25.13 
 
 
457 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  26.48 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  27.61 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1311  glucose-6-phosphate isomerase  33.03 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  25.32 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  25.06 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>