109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4368 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  100 
 
 		 727 aa  1459    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  41.56 
 
 		 736 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  35.34 
 
 		 752 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  35.84 
 
 		 752 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  30.6 
 
 		 746 aa  313  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  29.03 
 
 		 750 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  39.29 
 
 		 756 aa  303  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  33.58 
 
 		 757 aa  303  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  33.07 
 
 		 769 aa  301  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  34.45 
 
 		 745 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  39.08 
 
 		 769 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  38.87 
 
 		 763 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  38.87 
 
 		 763 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  34.45 
 
 		 745 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  38.87 
 
 		 763 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  38.87 
 
 		 716 aa  293  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  38.87 
 
 		 844 aa  293  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  32.18 
 
 		 762 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 766 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  38.24 
 
 		 745 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  38.24 
 
 		 745 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  37.47 
 
 		 745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  32.39 
 
 		 749 aa  273  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  25.25 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  27.09 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  26.62 
 
 		 630 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  29.06 
 
 		 584 aa  107  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  23.57 
 
 		 649 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  28.46 
 
 		 669 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  27.6 
 
 		 630 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  23.69 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  23.16 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  23.2 
 
 		 649 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  24.96 
 
 		 657 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.46 
 
 		 437 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  26.23 
 
 		 628 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  23.33 
 
 		 649 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  23.2 
 
 		 649 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  22.76 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  28.05 
 
 		 644 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  23.04 
 
 		 649 aa  91.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  23.04 
 
 		 649 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  23.04 
 
 		 649 aa  91.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  22.64 
 
 		 647 aa  88.2  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  28.82 
 
 		 438 aa  87.8  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.64 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  26 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  26.52 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.75 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  28.77 
 
 		 647 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.45 
 
 		 403 aa  83.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  27.13 
 
 		 575 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  24.09 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  27.59 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.84 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  29.93 
 
 		 397 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  24.93 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  23.1 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.55 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.71 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  24.37 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  26.26 
 
 		 573 aa  72  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  23.93 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  24.36 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.86 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  23.93 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  27.84 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  27.76 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  24.52 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.4 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  28.45 
 
 		 635 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  25.22 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  27.62 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  27.63 
 
 		 420 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  26.44 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  25.81 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  25.41 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  24.59 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  26 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.44 
 
 		 391 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  28.88 
 
 		 644 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  27.03 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  27.46 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  27.33 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  25 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  29.34 
 
 		 590 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  25.14 
 
 		 396 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  22.83 
 
 		 353 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  29.1 
 
 		 600 aa  54.3  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  26.57 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  24.12 
 
 		 388 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  24.82 
 
 		 575 aa  51.6  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  26.06 
 
 		 570 aa  51.2  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  25.43 
 
 		 587 aa  50.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  27.2 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  22.69 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  26.16 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  25.85 
 
 		 587 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  24.78 
 
 		 572 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>