93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3864 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
566 aa  1092    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  33.71 
 
 
647 aa  230  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  32.82 
 
 
649 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  32.99 
 
 
649 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  33.2 
 
 
649 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  32.86 
 
 
649 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  33.2 
 
 
649 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  34.48 
 
 
657 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  32.65 
 
 
649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  33.06 
 
 
649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  32.65 
 
 
649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  32.65 
 
 
649 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  32.65 
 
 
649 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  36.57 
 
 
669 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  31.54 
 
 
650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  35.67 
 
 
630 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  35.09 
 
 
630 aa  203  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  32.28 
 
 
644 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  37.31 
 
 
628 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  37.09 
 
 
647 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  36.18 
 
 
641 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  35.77 
 
 
607 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  33.68 
 
 
644 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  29.36 
 
 
752 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  33.53 
 
 
757 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  30.89 
 
 
752 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  22.53 
 
 
750 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  28.26 
 
 
404 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  31.19 
 
 
438 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.29 
 
 
745 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.44 
 
 
745 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  26.53 
 
 
746 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.88 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.88 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  28.29 
 
 
736 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  22.48 
 
 
769 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.89 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.8 
 
 
745 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.23 
 
 
756 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  23.96 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.88 
 
 
749 aa  77.4  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.84 
 
 
727 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.9 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.86 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  27.35 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.27 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.53 
 
 
763 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.53 
 
 
763 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.53 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  33.64 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.53 
 
 
716 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  26.37 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  29.6 
 
 
844 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  25.97 
 
 
766 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.4 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.53 
 
 
769 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.09 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.02 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  35.19 
 
 
570 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  29.64 
 
 
563 aa  65.1  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.55 
 
 
400 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.63 
 
 
403 aa  64.3  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.2 
 
 
406 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  27.48 
 
 
403 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  24.76 
 
 
400 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  28.51 
 
 
443 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.08 
 
 
403 aa  57  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28 
 
 
582 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.71 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  32.09 
 
 
600 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  28.36 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  25.11 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  21.75 
 
 
584 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.7 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.18 
 
 
575 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  27.66 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  29.45 
 
 
585 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  33.99 
 
 
587 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  22.99 
 
 
404 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  36.89 
 
 
420 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  31.05 
 
 
604 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  27.91 
 
 
555 aa  50.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  31.01 
 
 
590 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  27.45 
 
 
575 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  27.66 
 
 
388 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2097  hypothetical protein  25.42 
 
 
434 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1753  protein of unknown function DUF181  25.42 
 
 
434 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.65596  normal  0.50021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  33.04 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  25.15 
 
 
405 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  25.2 
 
 
635 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.57 
 
 
584 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0995  protein of unknown function DUF181  21.3 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>