91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0555 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1312    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  39.67 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  40.49 
 
 
647 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  39.05 
 
 
649 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  39.05 
 
 
649 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  39.26 
 
 
649 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  38.97 
 
 
649 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  38.96 
 
 
649 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  39.11 
 
 
649 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  39.11 
 
 
649 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  38.96 
 
 
649 aa  429  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  38.76 
 
 
649 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  38.78 
 
 
649 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  35.11 
 
 
630 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  34.28 
 
 
630 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  35.8 
 
 
669 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  33.33 
 
 
628 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  32.94 
 
 
641 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  31.85 
 
 
607 aa  227  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  34.48 
 
 
566 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  34.06 
 
 
644 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  30.39 
 
 
644 aa  190  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  30.48 
 
 
647 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  26.29 
 
 
750 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  28.9 
 
 
745 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.81 
 
 
745 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.79 
 
 
752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  26.32 
 
 
757 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.69 
 
 
746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.23 
 
 
769 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.31 
 
 
752 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.97 
 
 
745 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.36 
 
 
745 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.36 
 
 
745 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.01 
 
 
762 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.24 
 
 
749 aa  103  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  26.22 
 
 
438 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  26.04 
 
 
436 aa  97.4  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  24.96 
 
 
727 aa  97.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  26.59 
 
 
756 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.81 
 
 
763 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.81 
 
 
763 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.2 
 
 
437 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.84 
 
 
844 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.62 
 
 
716 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.62 
 
 
763 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.65 
 
 
769 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.62 
 
 
766 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  26.76 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.25 
 
 
736 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  29.52 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  28.7 
 
 
403 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  25.18 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  24.9 
 
 
400 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.86 
 
 
424 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  26.32 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  28.05 
 
 
426 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  26.2 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  30.67 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  29.81 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.45 
 
 
584 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  24.18 
 
 
420 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  26.25 
 
 
404 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1753  protein of unknown function DUF181  26.22 
 
 
434 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.65596  normal  0.50021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  31.09 
 
 
404 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2097  hypothetical protein  26.22 
 
 
434 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  29.55 
 
 
575 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  25.18 
 
 
563 aa  61.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  24.29 
 
 
420 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  26.16 
 
 
443 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.45 
 
 
403 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  23.43 
 
 
403 aa  58.5  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.63 
 
 
410 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  38.35 
 
 
420 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  24.82 
 
 
397 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  25.08 
 
 
600 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.2 
 
 
391 aa  55.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  23.74 
 
 
403 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  27.07 
 
 
585 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  23.65 
 
 
570 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
577 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  27.62 
 
 
590 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0995  protein of unknown function DUF181  19.59 
 
 
448 aa  48.9  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0689  hypothetical protein  28.32 
 
 
224 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.754104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  29.17 
 
 
582 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  35.53 
 
 
405 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  30 
 
 
635 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  30.16 
 
 
575 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  25 
 
 
533 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  22.96 
 
 
572 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  23.93 
 
 
580 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>