160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4992 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  60.95 
 
 		 716 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  61.65 
 
 		 844 aa  841    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  61.43 
 
 		 756 aa  845    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  87.52 
 
 		 745 aa  1226    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 745 aa  1494    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  87.52 
 
 		 745 aa  1226    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  61.52 
 
 		 763 aa  835    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  61.39 
 
 		 763 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  61.04 
 
 		 769 aa  836    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  61.28 
 
 		 766 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  61.39 
 
 		 763 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  88.32 
 
 		 745 aa  1255    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  96.78 
 
 		 745 aa  1400    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  33.11 
 
 		 750 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  31.76 
 
 		 746 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  31.63 
 
 		 762 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  35.64 
 
 		 757 aa  360  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  32.98 
 
 		 749 aa  351  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  34.25 
 
 		 752 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  30.01 
 
 		 769 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  33.59 
 
 		 752 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  35.06 
 
 		 727 aa  306  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  35.53 
 
 		 736 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  28.9 
 
 		 657 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  23.78 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  23.78 
 
 		 649 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  23.47 
 
 		 649 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  23.34 
 
 		 649 aa  124  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  23.1 
 
 		 649 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  23.29 
 
 		 649 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  30.62 
 
 		 650 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  23.1 
 
 		 649 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  23.1 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  25.44 
 
 		 649 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  22.92 
 
 		 649 aa  119  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  32.75 
 
 		 436 aa  117  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.31 
 
 		 404 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.57 
 
 		 647 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  25.39 
 
 		 628 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  26.87 
 
 		 669 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.07 
 
 		 644 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  26.15 
 
 		 630 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  28.21 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  27.88 
 
 		 426 aa  99  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  26.34 
 
 		 630 aa  99  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  27.14 
 
 		 607 aa  98.6  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.62 
 
 		 403 aa  97.8  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.09 
 
 		 403 aa  94.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.25 
 
 		 406 aa  94.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 641 aa  94  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  90.9  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.7 
 
 		 389 aa  90.1  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.54 
 
 		 400 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  28.75 
 
 		 403 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  26.62 
 
 		 400 aa  89  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  26.9 
 
 		 404 aa  89  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.01 
 
 		 575 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  27.01 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  25.25 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.18 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  30 
 
 		 572 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.57 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  27.3 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  27.79 
 
 		 582 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  26.52 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.6 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  26.2 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.64 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  27.68 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.55 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.97 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  28.42 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  27.7 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  27.61 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.07 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  25.96 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  25.54 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  28.08 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  29.7 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.9 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.07 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  25.09 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  39.5 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  27.5 
 
 		 600 aa  60.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  25.87 
 
 		 587 aa  60.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  31.06 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  23.24 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  27.44 
 
 		 563 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  22.38 
 
 		 597 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  25.13 
 
 		 536 aa  56.2  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  26.5 
 
 		 533 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  22.38 
 
 		 611 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  22.38 
 
 		 611 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  22.38 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  28.74 
 
 		 439 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  22.38 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  26.04 
 
 		 592 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>