54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3594 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  81.5 
 
 		 524 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  81.9 
 
 		 539 aa  873    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1068    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  81.9 
 
 		 552 aa  875    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  81.53 
 
 		 539 aa  870    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  42.51 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  43.03 
 
 		 523 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.6 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  25.74 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  24.25 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  27.76 
 
 		 763 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  27.76 
 
 		 763 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  22.36 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  27.42 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.42 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  27.42 
 
 		 769 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  27.42 
 
 		 844 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 766 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  26.77 
 
 		 403 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  26.76 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  23.75 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.5 
 
 		 745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  24.93 
 
 		 745 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  25.25 
 
 		 466 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.13 
 
 		 443 aa  53.9  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  21.54 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  25.41 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  24.74 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  25.52 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  25.52 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  24.57 
 
 		 649 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  24.59 
 
 		 649 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.14 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  23.39 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  23.29 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.1 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.55 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  24.51 
 
 		 649 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  23.37 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  26.95 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  24.63 
 
 		 649 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  24.63 
 
 		 649 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  24.24 
 
 		 649 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  23.14 
 
 		 650 aa  47.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25.69 
 
 		 745 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  23.78 
 
 		 396 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  23.76 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.65 
 
 		 750 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  25.7 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  23.09 
 
 		 405 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  23.72 
 
 		 649 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.92 
 
 		 404 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>