93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2590 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  91.9 
 
 
630 aa  1167    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1258    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  52.45 
 
 
669 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  47.77 
 
 
628 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  44.68 
 
 
641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  44.97 
 
 
607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  46.51 
 
 
644 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  45.04 
 
 
647 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  32.82 
 
 
647 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  32.19 
 
 
650 aa  278  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  35.07 
 
 
649 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  33.54 
 
 
649 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  34.21 
 
 
649 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  34.28 
 
 
657 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  33.81 
 
 
649 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  33.33 
 
 
649 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  33.33 
 
 
649 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  33.33 
 
 
649 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  33.13 
 
 
649 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  32.93 
 
 
649 aa  260  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  33.2 
 
 
649 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  35.67 
 
 
566 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  29.47 
 
 
644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.29 
 
 
750 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.77 
 
 
746 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  28.1 
 
 
757 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.24 
 
 
769 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.28 
 
 
762 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.47 
 
 
749 aa  115  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  31.54 
 
 
438 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.19 
 
 
752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  25.13 
 
 
752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.59 
 
 
437 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.52 
 
 
745 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.52 
 
 
745 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.67 
 
 
745 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.6 
 
 
727 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  29.12 
 
 
436 aa  100  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.34 
 
 
745 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  28.09 
 
 
763 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  27.6 
 
 
769 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  28.09 
 
 
763 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  28.09 
 
 
766 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  28.09 
 
 
716 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  28.09 
 
 
763 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.38 
 
 
745 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  28.09 
 
 
844 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.06 
 
 
756 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.25 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  35.76 
 
 
736 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  27.3 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.7 
 
 
466 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  27.12 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  28.03 
 
 
406 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.01 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  23.84 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  22.29 
 
 
584 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  21.84 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.59 
 
 
424 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  22.59 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.09 
 
 
404 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  23.47 
 
 
400 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25 
 
 
575 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  30.1 
 
 
389 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  27.72 
 
 
400 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  29.39 
 
 
443 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.55 
 
 
403 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  27.65 
 
 
400 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  31.25 
 
 
573 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  28.45 
 
 
445 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  27.74 
 
 
563 aa  57  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.31 
 
 
420 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  29.5 
 
 
590 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.36 
 
 
420 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  31 
 
 
585 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  34.13 
 
 
420 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  26.6 
 
 
416 aa  54.3  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  29.17 
 
 
391 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  30.63 
 
 
397 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  39.13 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  26.17 
 
 
600 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.73 
 
 
396 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  29.57 
 
 
580 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  23.83 
 
 
582 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  26.07 
 
 
587 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  27.78 
 
 
577 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  31.84 
 
 
405 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.38 
 
 
555 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  24.36 
 
 
575 aa  44.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  22.71 
 
 
572 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  23.28 
 
 
353 aa  44.3  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  28.08 
 
 
572 aa  44.3  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>