71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2408 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1170    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  54.43 
 
 
590 aa  594  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  53.94 
 
 
585 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  47.88 
 
 
604 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  42.09 
 
 
635 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  41.65 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  28.1 
 
 
404 aa  84  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.98 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  26.77 
 
 
727 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  28.4 
 
 
403 aa  77  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.15 
 
 
757 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  31.69 
 
 
404 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.91 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  28.44 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.11 
 
 
756 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.83 
 
 
763 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.83 
 
 
763 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.83 
 
 
716 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  26.29 
 
 
762 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.83 
 
 
763 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.83 
 
 
766 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.83 
 
 
844 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.52 
 
 
769 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  22.4 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.22 
 
 
752 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.8 
 
 
389 aa  67  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  26.52 
 
 
749 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24.29 
 
 
575 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.75 
 
 
388 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  24.5 
 
 
752 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  30.61 
 
 
391 aa  63.9  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.21 
 
 
424 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  32.82 
 
 
403 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.4 
 
 
769 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  31.34 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  30.24 
 
 
745 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  31.25 
 
 
630 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  27.6 
 
 
745 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
443 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  31.25 
 
 
630 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  30.77 
 
 
644 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  30.3 
 
 
745 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  30.05 
 
 
628 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  30.05 
 
 
745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  30.05 
 
 
745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  28.51 
 
 
647 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  22.79 
 
 
746 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  22.17 
 
 
404 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  29.6 
 
 
466 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  21.49 
 
 
400 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  23.85 
 
 
750 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  27.91 
 
 
420 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  22.73 
 
 
426 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  21.43 
 
 
400 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  21.13 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  28.11 
 
 
396 aa  51.6  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  24.63 
 
 
580 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  20.9 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.44 
 
 
641 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  29.25 
 
 
607 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  24.39 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  35.29 
 
 
420 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  29.09 
 
 
669 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  23.44 
 
 
353 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  31.58 
 
 
438 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  27.88 
 
 
647 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.16 
 
 
736 aa  47  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  23.62 
 
 
572 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  35 
 
 
566 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  24.86 
 
 
405 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  28.05 
 
 
650 aa  43.5  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>