133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1211 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  100 
 
 		 403 aa  811    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  61.54 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  63.18 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  62.94 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  58.9 
 
 		 403 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  58.81 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  46.01 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  44.15 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  45.36 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  41.03 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  44.86 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  44.95 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  40.51 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  44.88 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  37.47 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  37.6 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  38.48 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  35.1 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  34.02 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  35.77 
 
 		 391 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  32.91 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  33 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  35.38 
 
 		 882 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  31.69 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  32.66 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  26.91 
 
 		 750 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  27.25 
 
 		 584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  30.39 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  30.33 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  29.07 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  30.14 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.55 
 
 		 749 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  31.89 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.8 
 
 		 757 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  29.08 
 
 		 572 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  28.12 
 
 		 752 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  29.15 
 
 		 745 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.64 
 
 		 745 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  29.15 
 
 		 745 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  29.15 
 
 		 745 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28.54 
 
 		 582 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  28.75 
 
 		 745 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.41 
 
 		 752 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  23.94 
 
 		 769 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.5 
 
 		 746 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  29.28 
 
 		 647 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  27.93 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  26.32 
 
 		 647 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  27.84 
 
 		 438 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  29.11 
 
 		 641 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  28.24 
 
 		 607 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.62 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.05 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.01 
 
 		 630 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.24 
 
 		 762 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.61 
 
 		 844 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  27.47 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  28.34 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.32 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.61 
 
 		 769 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.32 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  29.16 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  26.44 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  26.49 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.32 
 
 		 716 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.32 
 
 		 763 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  28.66 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  25.07 
 
 		 649 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.09 
 
 		 650 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  33.45 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  25.22 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  25.14 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  25.22 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.71 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  25.22 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  24.22 
 
 		 649 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.62 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  25.22 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  28.45 
 
 		 600 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  27.55 
 
 		 669 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  26.05 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  26.12 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  26.57 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  29.15 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  29.11 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  30.65 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  29.31 
 
 		 736 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  26.77 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  26.95 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  27.01 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  23.56 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  28.19 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  27.78 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  25.38 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  29.63 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  30.04 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  28.61 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  26.14 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  23.9 
 
 		 657 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>