91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2435 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  100 
 
 		 630 aa  1260    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  91.9 
 
 		 630 aa  1167    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  52.75 
 
 		 669 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  46.32 
 
 		 628 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  44.33 
 
 		 641 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  44.39 
 
 		 607 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  46.54 
 
 		 644 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  44.33 
 
 		 647 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  32.54 
 
 		 650 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  32.59 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  35.27 
 
 		 649 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  35.11 
 
 		 657 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  34.75 
 
 		 649 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  33.87 
 
 		 649 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  33.87 
 
 		 649 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  33.47 
 
 		 649 aa  263  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  34.14 
 
 		 649 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  33.94 
 
 		 649 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  33.67 
 
 		 649 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  33.67 
 
 		 649 aa  260  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  33.67 
 
 		 649 aa  260  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  35.09 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  29.21 
 
 		 644 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.5 
 
 		 750 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.4 
 
 		 746 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  26.79 
 
 		 757 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  25.17 
 
 		 762 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25 
 
 		 769 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.37 
 
 		 749 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  26.62 
 
 		 727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  30.49 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  24.79 
 
 		 752 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  24.91 
 
 		 752 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.28 
 
 		 745 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.28 
 
 		 745 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.9 
 
 		 745 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  29.2 
 
 		 716 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  28.99 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 766 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  28.99 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  28.99 
 
 		 769 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  29.3 
 
 		 844 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  28.99 
 
 		 763 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.19 
 
 		 756 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.71 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  26.15 
 
 		 745 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.35 
 
 		 745 aa  100  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.07 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.64 
 
 		 403 aa  88.6  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  27.2 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  29.21 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.78 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.61 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.5 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.09 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  27.47 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  24.15 
 
 		 403 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  28.33 
 
 		 400 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  28.19 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  23.55 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  21.27 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  24.5 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.82 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  23.78 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  30.38 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  30.34 
 
 		 404 aa  63.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.62 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  27.59 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  30.11 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  31.25 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  30.73 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  27.3 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  26.67 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.05 
 
 		 420 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  28.02 
 
 		 410 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  27.75 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  30.81 
 
 		 600 aa  53.9  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  39.13 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  33.88 
 
 		 420 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.73 
 
 		 391 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  31.05 
 
 		 585 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  30.13 
 
 		 590 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  23.3 
 
 		 353 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.24 
 
 		 396 aa  47.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  30.17 
 
 		 582 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  29.17 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  27.83 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  25.96 
 
 		 575 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  29.38 
 
 		 405 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  25.62 
 
 		 577 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  30.33 
 
 		 572 aa  43.9  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>