92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2583 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  91.1 
 
 
641 aa  1085    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1202    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  54.06 
 
 
644 aa  565  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  45.57 
 
 
647 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  44.35 
 
 
630 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  43.95 
 
 
630 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  39.59 
 
 
669 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  41.4 
 
 
628 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  30.91 
 
 
650 aa  251  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  32.24 
 
 
647 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  32.79 
 
 
649 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  32.38 
 
 
649 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  32.45 
 
 
649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  32.08 
 
 
649 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  32.45 
 
 
649 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  32.45 
 
 
649 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  32.45 
 
 
649 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  32.28 
 
 
649 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  32.24 
 
 
649 aa  234  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  31.94 
 
 
649 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  31.85 
 
 
657 aa  226  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  33.33 
 
 
644 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  36.19 
 
 
566 aa  150  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25.19 
 
 
750 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.34 
 
 
757 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  24.6 
 
 
762 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.21 
 
 
746 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.46 
 
 
756 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  23.92 
 
 
769 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  28.4 
 
 
844 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  28.4 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  28.4 
 
 
769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  28.2 
 
 
716 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  28.2 
 
 
763 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  25.83 
 
 
727 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  28 
 
 
763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  28 
 
 
763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  25.74 
 
 
752 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  23.4 
 
 
749 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.24 
 
 
752 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.77 
 
 
437 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  29.47 
 
 
466 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  30.52 
 
 
403 aa  101  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.37 
 
 
745 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  25.1 
 
 
745 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  25.1 
 
 
745 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.84 
 
 
745 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.14 
 
 
745 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  29.28 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.06 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  26.82 
 
 
736 aa  91.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  27.89 
 
 
600 aa  84.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  28.24 
 
 
403 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  28.07 
 
 
404 aa  80.1  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  24.65 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  27.61 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  28.53 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  24.72 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  24.65 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  24.05 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.62 
 
 
403 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  24.65 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  31.65 
 
 
424 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24.13 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  27.51 
 
 
587 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  25.09 
 
 
404 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.28 
 
 
389 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  28.03 
 
 
577 aa  61.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  28.09 
 
 
570 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  27.19 
 
 
397 aa  60.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  28.53 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  29.25 
 
 
445 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  30.3 
 
 
404 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  28.46 
 
 
882 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24 
 
 
575 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  26.9 
 
 
420 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  30.46 
 
 
420 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.17 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  30.39 
 
 
391 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  29.27 
 
 
405 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  28.1 
 
 
585 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.47 
 
 
410 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  29.71 
 
 
573 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  27.61 
 
 
443 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  26.62 
 
 
590 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  33.9 
 
 
572 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  31.45 
 
 
396 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  23.75 
 
 
416 aa  44.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  26.16 
 
 
582 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  36.11 
 
 
353 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  27.63 
 
 
555 aa  43.9  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  25.29 
 
 
635 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>