78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0608 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
388 aa  786    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  50.53 
 
 
397 aa  359  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  38.95 
 
 
403 aa  250  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  37.11 
 
 
424 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  36.25 
 
 
426 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  36.29 
 
 
403 aa  235  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  36.67 
 
 
406 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  34.72 
 
 
400 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  37.69 
 
 
404 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  34.9 
 
 
400 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  34.2 
 
 
400 aa  226  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  35.7 
 
 
403 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  37.56 
 
 
403 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  37.47 
 
 
403 aa  215  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  31.23 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  33.6 
 
 
389 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  30.67 
 
 
443 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  30.11 
 
 
396 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  32.64 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  30.36 
 
 
405 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  32.04 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  28.85 
 
 
752 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  29.93 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  27.3 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.88 
 
 
584 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.17 
 
 
575 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.65 
 
 
752 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  24.05 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.25 
 
 
572 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.47 
 
 
769 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  28.53 
 
 
745 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  26.28 
 
 
420 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  26.33 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  30.04 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  30.04 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.7 
 
 
745 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.12 
 
 
750 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  25.06 
 
 
575 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  23.04 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  29.28 
 
 
745 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  23.47 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  26.61 
 
 
582 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  24.62 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.54 
 
 
584 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  23.05 
 
 
749 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  23.66 
 
 
762 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 
572 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  25.76 
 
 
555 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  25 
 
 
635 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  25.84 
 
 
573 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  25.94 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  28.73 
 
 
580 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  29.38 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.72 
 
 
763 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.72 
 
 
763 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.72 
 
 
716 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.72 
 
 
769 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.72 
 
 
844 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.72 
 
 
766 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.72 
 
 
763 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  24.12 
 
 
727 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  23.17 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  28.63 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.45 
 
 
436 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  30.72 
 
 
570 aa  50.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  27.39 
 
 
587 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  30.56 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  26.42 
 
 
584 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  27.66 
 
 
566 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  26.62 
 
 
647 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  28.84 
 
 
600 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  25.51 
 
 
756 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  22.51 
 
 
882 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  29.52 
 
 
577 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  26.71 
 
 
736 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  24.65 
 
 
486 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  25 
 
 
604 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  25.26 
 
 
590 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>