111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6310 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
443 aa  882    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  53.93 
 
 
389 aa  359  6e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  39.22 
 
 
403 aa  229  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  39.95 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  37.69 
 
 
404 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  39.45 
 
 
420 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  33.82 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  37.15 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  37.6 
 
 
403 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  34.87 
 
 
403 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  32.1 
 
 
403 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  34.91 
 
 
406 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  33.75 
 
 
391 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  35.26 
 
 
396 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  32.64 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  31.87 
 
 
400 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  33.59 
 
 
403 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  31.61 
 
 
400 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  32.13 
 
 
424 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  31.47 
 
 
426 aa  171  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  32.68 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  33.17 
 
 
439 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  36.75 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  31.96 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  26 
 
 
404 aa  136  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  31.09 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  31.76 
 
 
882 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  30.67 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  34.78 
 
 
409 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.72 
 
 
584 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.85 
 
 
575 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25.06 
 
 
750 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  28.17 
 
 
584 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.37 
 
 
769 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  27.21 
 
 
757 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  27.52 
 
 
749 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  34.26 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  32.04 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.04 
 
 
756 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  30.61 
 
 
585 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.59 
 
 
727 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.69 
 
 
582 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  26.74 
 
 
572 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  27.51 
 
 
763 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  27.51 
 
 
763 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  27.78 
 
 
769 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.78 
 
 
766 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  29.11 
 
 
649 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  27.78 
 
 
844 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  27.25 
 
 
716 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  24.47 
 
 
752 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.25 
 
 
763 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  30.77 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.35 
 
 
746 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  24.42 
 
 
575 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0907  protein of unknown function DUF181  32.25 
 
 
379 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0911  protein of unknown function DUF181  32.25 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  29.85 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  29.85 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  25.06 
 
 
752 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0862  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128002  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  27.51 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  23.68 
 
 
762 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.06 
 
 
580 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  28.08 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  26.19 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  27.12 
 
 
647 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  29.2 
 
 
745 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.61 
 
 
745 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  26.53 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  25.51 
 
 
572 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  26.19 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25 
 
 
745 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  25.6 
 
 
649 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  25.6 
 
 
649 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  24.66 
 
 
649 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  24.66 
 
 
649 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  25.61 
 
 
649 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  25.65 
 
 
590 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  31.6 
 
 
736 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  30.11 
 
 
630 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.15 
 
 
650 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.39 
 
 
630 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  24.46 
 
 
573 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  31.23 
 
 
420 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  25.26 
 
 
649 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  22.94 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.16 
 
 
657 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  28.51 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  25.16 
 
 
539 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  31.78 
 
 
604 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  25.13 
 
 
533 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.15 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  24.25 
 
 
552 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  28.32 
 
 
563 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  32.17 
 
 
644 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  23.9 
 
 
539 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  24.73 
 
 
635 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  25.85 
 
 
644 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  43.24 
 
 
669 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>