104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3967 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  100 
 
 		 752 aa  1523    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  84.97 
 
 		 752 aa  1249    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  37.97 
 
 		 750 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  39.61 
 
 		 762 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  38.81 
 
 		 769 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  37.28 
 
 		 746 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  39.49 
 
 		 757 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  37.09 
 
 		 749 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  34.42 
 
 		 745 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  34.33 
 
 		 745 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  34.02 
 
 		 745 aa  347  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  34.39 
 
 		 745 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  34.39 
 
 		 745 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  34.14 
 
 		 844 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  33.76 
 
 		 769 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  33.94 
 
 		 756 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  33.51 
 
 		 763 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  33.51 
 
 		 763 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  33.76 
 
 		 766 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  33.38 
 
 		 763 aa  320  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  35.88 
 
 		 727 aa  316  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  33.98 
 
 		 716 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  33.99 
 
 		 736 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.09 
 
 		 650 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.41 
 
 		 649 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  26.02 
 
 		 649 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  26.31 
 
 		 649 aa  138  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.79 
 
 		 657 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  26.31 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  26.01 
 
 		 649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  26.14 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  26.14 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  30.99 
 
 		 404 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  25.93 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  26.14 
 
 		 649 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  25.16 
 
 		 649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.73 
 
 		 403 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.47 
 
 		 647 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  27.07 
 
 		 424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  24.62 
 
 		 630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  25.19 
 
 		 630 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  25.21 
 
 		 607 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  25.04 
 
 		 641 aa  114  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  27.39 
 
 		 566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  27.31 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  27.81 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  29.48 
 
 		 406 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 		 403 aa  110  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  25.8 
 
 		 628 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  28.85 
 
 		 397 aa  106  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  25.87 
 
 		 669 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  26.01 
 
 		 644 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.41 
 
 		 404 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.78 
 
 		 426 aa  98.2  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  25.12 
 
 		 584 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  27.91 
 
 		 438 aa  97.8  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  28.12 
 
 		 403 aa  94.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.7 
 
 		 400 aa  91.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24.53 
 
 		 575 aa  91.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  29.26 
 
 		 575 aa  90.9  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  25.14 
 
 		 403 aa  90.9  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  25.21 
 
 		 400 aa  89.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  30.98 
 
 		 436 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.49 
 
 		 420 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  25.42 
 
 		 400 aa  88.2  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  27.51 
 
 		 585 aa  87.4  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  27.82 
 
 		 420 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  28.85 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  30.66 
 
 		 635 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.19 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  27.07 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  25.85 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.42 
 
 		 580 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.34 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  24.47 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  25.65 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  26.56 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  27.83 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  26.24 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  25.48 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  28.11 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  31.45 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  24.92 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  25.87 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  30.82 
 
 		 410 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  26.16 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  24.7 
 
 		 573 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  23.77 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  29.76 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  25.88 
 
 		 353 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  22.38 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  23.8 
 
 		 604 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  22.97 
 
 		 587 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  26.57 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  25.13 
 
 		 405 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  22.97 
 
 		 728 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  25.36 
 
 		 735 aa  49.3  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3627  hypothetical protein  26.64 
 
 		 407 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  27.1 
 
 		 563 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  27.04 
 
 		 570 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>