102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4196 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  865    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  32.66 
 
 		 745 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  32.66 
 
 		 745 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  33.42 
 
 		 745 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  26.34 
 
 		 650 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  32.41 
 
 		 745 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  30.38 
 
 		 669 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  32.41 
 
 		 745 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  25.32 
 
 		 649 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  24.81 
 
 		 649 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  25.45 
 
 		 649 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  24.81 
 
 		 649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  24.55 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.81 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  27.79 
 
 		 750 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  31.55 
 
 		 644 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.81 
 
 		 647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.45 
 
 		 757 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  30.37 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  30.37 
 
 		 647 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  30.08 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.12 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  28.07 
 
 		 630 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.04 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.79 
 
 		 641 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  28.06 
 
 		 607 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  27.53 
 
 		 762 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25.67 
 
 		 769 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.95 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  30.98 
 
 		 752 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  26.97 
 
 		 746 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.55 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  29.46 
 
 		 752 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  28.82 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  28.64 
 
 		 727 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.21 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  27.71 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.08 
 
 		 763 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.08 
 
 		 763 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  30.08 
 
 		 716 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  30.08 
 
 		 769 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  30.08 
 
 		 844 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  30.08 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  27.96 
 
 		 587 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.07 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  28.49 
 
 		 628 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  27.86 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  28.61 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.3 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.35 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  29.11 
 
 		 736 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  25.9 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  30.38 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  30.77 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  24.23 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.33 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  29.25 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  30.65 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  28.34 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  29.84 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  31.17 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  29.84 
 
 		 600 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  28.34 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  27.24 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  26.62 
 
 		 882 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  25.68 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  31.94 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  30.53 
 
 		 570 aa  60.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  32.4 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  26.36 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  27.6 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  26.86 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  25.7 
 
 		 575 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  28.08 
 
 		 577 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.28 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.7 
 
 		 584 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  25.96 
 
 		 587 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.45 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  32.19 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  24.33 
 
 		 353 aa  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  28 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  23.78 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  23.01 
 
 		 575 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  26.95 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  26.39 
 
 		 585 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  24.84 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  25.97 
 
 		 611 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  25.97 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  25.61 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.56 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  25.61 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  25.58 
 
 		 597 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  25.58 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  25.58 
 
 		 611 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>