54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2805 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  93.88 
 
 
552 aa  1025    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  81.53 
 
 
533 aa  870    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  79.37 
 
 
524 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
539 aa  1078    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  93.69 
 
 
539 aa  1019    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  43.8 
 
 
486 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  40.72 
 
 
523 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.17 
 
 
406 aa  84  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  26.44 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  25.37 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  25.55 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24.39 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.03 
 
 
404 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  23.01 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.69 
 
 
424 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  23.27 
 
 
403 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.16 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.2 
 
 
420 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.13 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.4 
 
 
403 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  24.81 
 
 
649 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  24.74 
 
 
649 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  23.86 
 
 
649 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  25.86 
 
 
397 aa  53.9  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  23.71 
 
 
649 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  23.71 
 
 
649 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  23.92 
 
 
649 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  23.99 
 
 
750 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  22.25 
 
 
650 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  24.87 
 
 
649 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  23.59 
 
 
649 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  23.59 
 
 
649 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  22.36 
 
 
396 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  25.49 
 
 
763 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  25.49 
 
 
763 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  27.89 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  24.46 
 
 
420 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  25.49 
 
 
769 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.16 
 
 
716 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  23.27 
 
 
400 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.16 
 
 
763 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  23.6 
 
 
649 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  25.16 
 
 
766 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  25.16 
 
 
844 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  20.25 
 
 
400 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  20 
 
 
400 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  25.71 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  23.96 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  23.96 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  26.59 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  23.73 
 
 
405 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  27.78 
 
 
882 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  24.24 
 
 
756 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  24.12 
 
 
410 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>