48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3428 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 523 aa  1015    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  43.8 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2805  protein of unknown function DUF181  42.52 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3594  hypothetical protein  42.69 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.962368  decreased coverage  0.00021638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  42.46 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2287  hypothetical protein  44.2 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0576552  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2910  protein of unknown function DUF181  42.01 
 
 		 539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  26.2 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  26.37 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  27.09 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  27.14 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  21.5 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  22.56 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  25.31 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  24.15 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  22.5 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  22.06 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.44 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.56 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  24.25 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  27.37 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  24.53 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  26.58 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.09 
 
 		 389 aa  53.9  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  21.88 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.86 
 
 		 644 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  20.91 
 
 		 735 aa  47.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  23.84 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  47  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  27.04 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  27.44 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  23.63 
 
 		 732 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  26.85 
 
 		 585 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  26.77 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  23.72 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  23.79 
 
 		 587 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.39 
 
 		 649 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  21.08 
 
 		 728 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  24.61 
 
 		 649 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>