58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11404 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  888    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  35 
 
 
403 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  35.96 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  33.17 
 
 
443 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  33.44 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  33.42 
 
 
420 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  31.44 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  32.84 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  29.28 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  31.56 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  32.77 
 
 
389 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  33.68 
 
 
420 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  30.73 
 
 
426 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  27.3 
 
 
403 aa  123  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  32.81 
 
 
397 aa  123  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  33.65 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  29.46 
 
 
403 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  28.89 
 
 
400 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  33.97 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  34.11 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  28.95 
 
 
400 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  29.68 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  30.13 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  31.89 
 
 
403 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  29.04 
 
 
403 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.84 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  27.3 
 
 
388 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1990  hypothetical protein  36.7 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  30.38 
 
 
882 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6108  hypothetical protein  24.91 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0919  hypothetical protein  31.95 
 
 
379 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114838  normal  0.819087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  27.24 
 
 
745 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  27.24 
 
 
745 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.35 
 
 
749 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  28.74 
 
 
745 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.21 
 
 
745 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  24.08 
 
 
769 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  26.49 
 
 
745 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.91 
 
 
757 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  30.47 
 
 
750 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  33.33 
 
 
746 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  27.09 
 
 
736 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  25.12 
 
 
762 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.97 
 
 
769 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  27.33 
 
 
844 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.14 
 
 
575 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.62 
 
 
716 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.27 
 
 
756 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.89 
 
 
584 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.88 
 
 
763 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  24.91 
 
 
575 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.88 
 
 
766 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.54 
 
 
763 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.54 
 
 
763 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  29.27 
 
 
578 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  26.77 
 
 
523 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  24.29 
 
 
586 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  30.07 
 
 
445 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>