61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4233 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  896    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  35.7 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  27.78 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.86 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  29.52 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  24.13 
 
 		 650 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  22.07 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  21.81 
 
 		 649 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  21.54 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  22.04 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  22.34 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  21.54 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  21.54 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  21.54 
 
 		 649 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  21.54 
 
 		 649 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  30.45 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  26.95 
 
 		 649 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.86 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  25.62 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  28.45 
 
 		 630 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  27.23 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  28.67 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  27.3 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  29.25 
 
 		 607 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  30.41 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.96 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.3 
 
 		 749 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  31.47 
 
 		 587 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  31.18 
 
 		 644 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  24.09 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.17 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  29 
 
 		 600 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  22.01 
 
 		 746 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  32.26 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  28.63 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  28.14 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  30.41 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  30.13 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  24.89 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  23.84 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  23.12 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.61 
 
 		 756 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  28.87 
 
 		 570 aa  47.4  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.61 
 
 		 763 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  27.61 
 
 		 763 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  27.61 
 
 		 763 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 766 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  29.68 
 
 		 585 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  25.71 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  27.61 
 
 		 716 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  27.44 
 
 		 844 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  27.61 
 
 		 769 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  23.32 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  23.55 
 
 		 757 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  30.43 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25.93 
 
 		 745 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  23.04 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  24.74 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.61 
 
 		 745 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  32.21 
 
 		 566 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11404  hypothetical protein  30.07 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.430879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>