86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4198 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1279    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  28.98 
 
 		 647 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 649 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  29.46 
 
 		 649 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  29.24 
 
 		 649 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  29.07 
 
 		 649 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  28.13 
 
 		 649 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  29.24 
 
 		 649 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  29.69 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  29.69 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  28.06 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.85 
 
 		 649 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  30.39 
 
 		 657 aa  191  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  27.43 
 
 		 650 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  32.95 
 
 		 669 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  32.28 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  29.47 
 
 		 630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  29.21 
 
 		 630 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  29.97 
 
 		 644 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  33.17 
 
 		 641 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  31.03 
 
 		 647 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  32.41 
 
 		 628 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  26.32 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  27.2 
 
 		 750 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.02 
 
 		 749 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  27.51 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  28.61 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  25.44 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  25.64 
 
 		 763 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  25.64 
 
 		 763 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  26.62 
 
 		 756 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.64 
 
 		 716 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 766 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.3 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.16 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.64 
 
 		 763 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  25.25 
 
 		 844 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  22.24 
 
 		 746 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  28.89 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  28.89 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  25.91 
 
 		 406 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  26.47 
 
 		 752 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  24.58 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  21.12 
 
 		 769 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  29.48 
 
 		 757 aa  68.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  21.41 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  27.71 
 
 		 745 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  25.36 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  27.25 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  23.61 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  31.05 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  24.46 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  27.12 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  19.72 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  27.34 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  24.85 
 
 		 752 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  24.46 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  28.68 
 
 		 600 aa  61.6  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.18 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  26.85 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  25.74 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  29 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  28.88 
 
 		 727 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  25.68 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  25.71 
 
 		 575 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  24.47 
 
 		 403 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  26.64 
 
 		 397 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  25.6 
 
 		 420 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4233  hypothetical protein  31.18 
 
 		 445 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.14 
 
 		 424 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  28.43 
 
 		 391 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  26.22 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  22.49 
 
 		 403 aa  53.5  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  24.91 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  33.58 
 
 		 572 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.85 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  23.2 
 
 		 404 aa  50.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  31.72 
 
 		 582 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  29.77 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  26.49 
 
 		 405 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1939  protein of unknown function DUF181  26.36 
 
 		 587 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  27.62 
 
 		 882 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2683  hypothetical protein  24.62 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2219  protein of unknown function DUF181  27.14 
 
 		 577 aa  44.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.540724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  28.04 
 
 		 486 aa  43.9  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>