89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0890 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
592 aa  1219    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  48.72 
 
 
586 aa  523  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  47.53 
 
 
586 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  48.81 
 
 
586 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  47.53 
 
 
587 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  48.81 
 
 
597 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  48.81 
 
 
611 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  48.81 
 
 
597 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  48.64 
 
 
611 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  47.71 
 
 
587 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  47.53 
 
 
586 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  47.7 
 
 
586 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  47.87 
 
 
586 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  47.84 
 
 
582 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  48.21 
 
 
587 aa  505  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  46.85 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  46.85 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  46.85 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  47.63 
 
 
587 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  47.87 
 
 
587 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  46.84 
 
 
576 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  44.56 
 
 
578 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  40.1 
 
 
727 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  38.8 
 
 
592 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  38.97 
 
 
729 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  39.49 
 
 
728 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  39 
 
 
729 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  38.8 
 
 
742 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  38.8 
 
 
742 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  38.94 
 
 
728 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  38.97 
 
 
742 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  38.63 
 
 
729 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  38.46 
 
 
728 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  38.83 
 
 
729 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  38.49 
 
 
728 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  38.14 
 
 
728 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  38.8 
 
 
728 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  39.83 
 
 
734 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  40.62 
 
 
732 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  37.93 
 
 
728 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  40.47 
 
 
616 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  37.95 
 
 
728 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  39.9 
 
 
734 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  39.56 
 
 
731 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  37.54 
 
 
728 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  39.35 
 
 
734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  37.97 
 
 
728 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  37.88 
 
 
728 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  38.88 
 
 
728 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  38.88 
 
 
728 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  38.88 
 
 
728 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  38.71 
 
 
734 aa  399  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  45.08 
 
 
584 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  39.41 
 
 
735 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  43.13 
 
 
734 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  34.23 
 
 
540 aa  334  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  34.85 
 
 
536 aa  307  3e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  26 
 
 
618 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.64 
 
 
580 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  24.86 
 
 
572 aa  60.8  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  30.96 
 
 
736 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.4 
 
 
716 aa  57  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.07 
 
 
745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.4 
 
 
763 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.4 
 
 
763 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.4 
 
 
766 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.4 
 
 
763 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.12 
 
 
745 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.4 
 
 
844 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.12 
 
 
745 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.59 
 
 
745 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.14 
 
 
769 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  28.9 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  25.95 
 
 
745 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  25.59 
 
 
756 aa  52  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3428  protein of unknown function DUF181  24.25 
 
 
523 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.08555  normal  0.0313518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  24.53 
 
 
406 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  27.2 
 
 
727 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 
584 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  27.64 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  23.47 
 
 
575 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  23.96 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  27.69 
 
 
582 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  27.98 
 
 
572 aa  44.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>