74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0463 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
540 aa  1108    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  56.69 
 
 
536 aa  626  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  34.68 
 
 
578 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  35.46 
 
 
586 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  35.28 
 
 
586 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  35.28 
 
 
586 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  36.14 
 
 
611 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  35.28 
 
 
586 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  35.28 
 
 
586 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  35.28 
 
 
586 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  35.11 
 
 
586 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  36.14 
 
 
597 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  36.14 
 
 
586 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  36.14 
 
 
597 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  35.97 
 
 
611 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  35.11 
 
 
586 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  35.11 
 
 
586 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  34.37 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  34.89 
 
 
587 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  34.25 
 
 
586 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  36.47 
 
 
587 aa  333  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  34.07 
 
 
582 aa  331  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  36.33 
 
 
587 aa  329  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  38.46 
 
 
587 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  40.32 
 
 
584 aa  326  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  34.23 
 
 
592 aa  324  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  35.83 
 
 
588 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  35.83 
 
 
588 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  35.83 
 
 
588 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  33.22 
 
 
576 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  34.37 
 
 
728 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  33.82 
 
 
742 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  34.88 
 
 
742 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  33.64 
 
 
742 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  35.97 
 
 
728 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  34.17 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  34.17 
 
 
729 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  34.17 
 
 
729 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  35.71 
 
 
728 aa  309  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  33.27 
 
 
592 aa  309  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  33.98 
 
 
729 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  35.36 
 
 
728 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  33.27 
 
 
728 aa  307  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  33.79 
 
 
728 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  32.58 
 
 
727 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  32.72 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  34.07 
 
 
735 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  35.43 
 
 
728 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  34.94 
 
 
728 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  35.85 
 
 
728 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  35 
 
 
732 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  32.87 
 
 
734 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  36.77 
 
 
734 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  32.83 
 
 
731 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  35.6 
 
 
734 aa  297  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  31.84 
 
 
616 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  36.28 
 
 
734 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  36.43 
 
 
728 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  36.43 
 
 
728 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  36.43 
 
 
728 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  34.17 
 
 
734 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  31.81 
 
 
728 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  27.25 
 
 
618 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  25.4 
 
 
584 aa  54.3  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  22.89 
 
 
745 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  20.36 
 
 
745 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  28.14 
 
 
572 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  24.45 
 
 
580 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  22.22 
 
 
745 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  22.22 
 
 
745 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  24.8 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.98 
 
 
396 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  27.89 
 
 
575 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  24.81 
 
 
749 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>