78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0114 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1092    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  56.69 
 
 		 540 aa  626  1e-178  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  40.5 
 
 		 728 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  36.45 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  35.54 
 
 		 728 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  40.62 
 
 		 728 aa  360  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  35.83 
 
 		 582 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  39.67 
 
 		 742 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  39.67 
 
 		 742 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  39.46 
 
 		 742 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  39.67 
 
 		 729 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  39.46 
 
 		 729 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  39.67 
 
 		 728 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  39.46 
 
 		 729 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  35.65 
 
 		 584 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  39.46 
 
 		 728 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  38.82 
 
 		 728 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  39.25 
 
 		 729 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  39.25 
 
 		 592 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  36.74 
 
 		 734 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  35.53 
 
 		 731 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  35.68 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  36.51 
 
 		 735 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  37.06 
 
 		 732 aa  347  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  39.26 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  39.26 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  39.36 
 
 		 734 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  36.19 
 
 		 728 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  39.17 
 
 		 728 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  38.84 
 
 		 728 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  35.52 
 
 		 616 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  34.31 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  39.43 
 
 		 734 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  36.6 
 
 		 734 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  36.1 
 
 		 587 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  36.11 
 
 		 727 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  38.54 
 
 		 734 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  35.7 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  35.64 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  35.47 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  35.64 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  35.64 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  35.64 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  35.64 
 
 		 586 aa  334  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  35.64 
 
 		 586 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  35.47 
 
 		 586 aa  333  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  35.81 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  35.41 
 
 		 611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  35.23 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  35.23 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  35.23 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  34.09 
 
 		 576 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  35.23 
 
 		 611 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  34.78 
 
 		 586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  35.88 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  35.88 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  35.88 
 
 		 588 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  35.81 
 
 		 587 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  35.81 
 
 		 587 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  34.38 
 
 		 587 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  34.85 
 
 		 592 aa  294  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  28.15 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.13 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.13 
 
 		 745 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.41 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  24.83 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  24.83 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  24.14 
 
 		 745 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 395 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924768  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  28.63 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  28.21 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  22.91 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.23 
 
 		 575 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  30.14 
 
 		 763 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  26 
 
 		 572 aa  44.3  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  30.14 
 
 		 763 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  25.29 
 
 		 403 aa  43.5  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>