92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2241 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  81.68 
 
 
586 aa  994    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  81.91 
 
 
586 aa  999    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  81.68 
 
 
586 aa  994    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  81.43 
 
 
588 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  81.68 
 
 
586 aa  994    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  81.68 
 
 
586 aa  996    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  83.3 
 
 
587 aa  992    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  81.43 
 
 
588 aa  992    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  81.43 
 
 
588 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  81.68 
 
 
586 aa  994    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  81.51 
 
 
586 aa  991    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  81.51 
 
 
586 aa  994    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  80.03 
 
 
611 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  79.69 
 
 
597 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  79.86 
 
 
611 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  79.86 
 
 
597 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  79.69 
 
 
586 aa  981    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  81.85 
 
 
586 aa  996    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
587 aa  1212    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  81.68 
 
 
586 aa  994    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  89.25 
 
 
587 aa  1077    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  86.5 
 
 
587 aa  1035    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  86.18 
 
 
587 aa  1018    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  51.2 
 
 
578 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  52.6 
 
 
576 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  50.61 
 
 
582 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  47.59 
 
 
729 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  47.41 
 
 
729 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  47.01 
 
 
728 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  47.41 
 
 
729 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  47.41 
 
 
729 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  47.76 
 
 
728 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  48.36 
 
 
728 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  47.06 
 
 
728 aa  552  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  47.15 
 
 
728 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  48.01 
 
 
727 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  46.38 
 
 
592 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  46.9 
 
 
728 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  45.86 
 
 
742 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  46.55 
 
 
728 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  45.81 
 
 
742 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  48.62 
 
 
732 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  46.38 
 
 
728 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  45.64 
 
 
742 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  45.94 
 
 
728 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  47.69 
 
 
728 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  45.69 
 
 
728 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  48.37 
 
 
616 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  47.85 
 
 
731 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  48.17 
 
 
735 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  48.2 
 
 
734 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  48.54 
 
 
734 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  47.52 
 
 
728 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  47.35 
 
 
728 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  47.6 
 
 
734 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  47.18 
 
 
728 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  46.14 
 
 
734 aa  525  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  47.06 
 
 
734 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  47.53 
 
 
592 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  43.9 
 
 
584 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  34.37 
 
 
540 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  35.7 
 
 
536 aa  335  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  27.45 
 
 
618 aa  163  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.29 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  27.16 
 
 
572 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  24.09 
 
 
580 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.09 
 
 
745 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  26.41 
 
 
745 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  28.91 
 
 
575 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  24.28 
 
 
745 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  24.28 
 
 
745 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  23.83 
 
 
745 aa  53.9  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  28.17 
 
 
584 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  25.92 
 
 
736 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  25.96 
 
 
436 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  30.58 
 
 
584 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  25.4 
 
 
353 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  26.16 
 
 
727 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  25.27 
 
 
716 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  25.27 
 
 
766 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  25.27 
 
 
763 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  25.6 
 
 
353 aa  47.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  25.27 
 
 
844 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  24.91 
 
 
763 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  24.91 
 
 
763 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  27.93 
 
 
572 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  25.37 
 
 
396 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.06 
 
 
756 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  27.44 
 
 
426 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  24.91 
 
 
769 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  27.59 
 
 
752 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  27.14 
 
 
403 aa  43.9  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>